More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0091 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 287 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 287 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  97.57 
 
 		 288 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.85 
 
 		 287 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.8 
 
 		 287 aa  521  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  81.82 
 
 		 286 aa  478  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.23 
 
 		 913 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.07 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.33 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  54.35 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  54.35 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.51 
 
 		 710 aa  293  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.56 
 
 		 299 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.88 
 
 		 304 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.88 
 
 		 306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  51.62 
 
 		 306 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  54.18 
 
 		 903 aa  279  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.72 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.35 
 
 		 301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.35 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.2 
 
 		 303 aa  255  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.2 
 
 		 303 aa  255  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3584  putative 3-oxo-(acyl) acyl carrier protein reductase  47.16 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 		 305 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 		 305 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.72 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.95 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  46.24 
 
 		 901 aa  246  4e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130256  normal  0.744191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.87 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.9 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.65 
 
 		 305 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.26 
 
 		 302 aa  235  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  47.6 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 		 304 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.119324 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.63 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 305 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.62 
 
 		 303 aa  224  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.22 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.49 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.2 
 
 		 334 aa  222  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 		 304 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.92 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.13 
 
 		 315 aa  221  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  42.86 
 
 		 893 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.21 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.57 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.29 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.4 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.72 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.54 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.54 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.54 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.91 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2572  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.38 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  46.75 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.49 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0205558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.91 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  50 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.75 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  43.9 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  44.71 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  44.71 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.5 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.27323  normal  0.448536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  44.71 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.11 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3902  putative short-chain dehydrogenase  44.54 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  44.71 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  43.14 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  42.53 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 		 320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>