More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2739 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
311 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.24 
 
 
351 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.09 
 
 
309 aa  342  4e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.86 
 
 
301 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.21 
 
 
310 aa  324  9e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.59 
 
 
301 aa  321  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.77 
 
 
301 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  56.42 
 
 
301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  56.42 
 
 
301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  56.42 
 
 
301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  55.1 
 
 
301 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  56.12 
 
 
301 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  53.85 
 
 
304 aa  300  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.85 
 
 
301 aa  298  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.31 
 
 
301 aa  292  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  54.55 
 
 
293 aa  289  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  54.27 
 
 
291 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.8 
 
 
301 aa  287  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1440  short chain dehydrogenase  51.19 
 
 
292 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110172  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.54 
 
 
295 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0301086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1567  short chain dehydrogenase  48.49 
 
 
292 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 
332 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.47 
 
 
300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2162  short chain dehydrogenase  44.26 
 
 
292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0642494  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.46 
 
 
298 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.6 
 
 
316 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.44 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.389719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 
299 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
298 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4620  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.44 
 
 
307 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4708  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.44 
 
 
307 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
307 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.857131  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5003  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.12 
 
 
306 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518156  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13536  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.58 
 
 
317 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.721751  hitchhiker  0.00000286322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
287 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
287 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 
288 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
913 aa  202  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1553  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.69 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 
287 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5894  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.64 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
305 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
308 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.263864  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5205  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.21 
 
 
307 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.152871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
304 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 
292 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.42 
 
 
710 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  44.57 
 
 
286 aa  192  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
306 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  44.92 
 
 
303 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.7 
 
 
303 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  44.92 
 
 
303 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
303 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.94 
 
 
305 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
308 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  decreased coverage  0.000184806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  44.75 
 
 
306 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
303 aa  188  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
306 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
306 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 
304 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
306 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.56 
 
 
309 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.555995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  42.7 
 
 
304 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  42.19 
 
 
305 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  46.12 
 
 
292 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.8 
 
 
305 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.38 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.27323  normal  0.448536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
303 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3902  putative short-chain dehydrogenase  44.44 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
304 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.11 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
320 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
301 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.37 
 
 
301 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  47.09 
 
 
903 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
313 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
300 aa  175  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  40.66 
 
 
901 aa  175  9e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 
302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
306 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
302 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2503  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 
246 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.37 
 
 
303 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.37 
 
 
303 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.69 
 
 
245 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>