More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0375 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  100 
 
 		 364 aa  717    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  81.89 
 
 		 387 aa  569  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  79.94 
 
 		 359 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  79.11 
 
 		 357 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  79.11 
 
 		 359 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  74.5 
 
 		 357 aa  507  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  72.98 
 
 		 357 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  74.17 
 
 		 360 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  69.47 
 
 		 374 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  67.6 
 
 		 373 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  58.02 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  58.29 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  56.95 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  55.53 
 
 		 370 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  54.76 
 
 		 368 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  50.55 
 
 		 362 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  51.37 
 
 		 367 aa  352  7e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  56 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  51.4 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  50.84 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  50.28 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.28 
 
 		 364 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  50.56 
 
 		 364 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  47.51 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  49.44 
 
 		 364 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  50.56 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  49.59 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  50.28 
 
 		 359 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  50.7 
 
 		 362 aa  323  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  50 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  51.69 
 
 		 362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  48.88 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  53.89 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  51.69 
 
 		 362 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  51.69 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  50.57 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  48.1 
 
 		 366 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  50 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  49.71 
 
 		 359 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  49.16 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  49 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  47.41 
 
 		 356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  49.57 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  50.96 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  47.86 
 
 		 360 aa  292  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  46.37 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  44.29 
 
 		 353 aa  275  8e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  40.62 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  35.55 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  35.55 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.37 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  36.99 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  37.06 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  34.35 
 
 		 369 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  37.39 
 
 		 353 aa  199  7e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  35.51 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  35.9 
 
 		 372 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  38.11 
 
 		 367 aa  195  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  35.26 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  35.51 
 
 		 359 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  34.95 
 
 		 371 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  36.44 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  36.13 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  35.5 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  45.04 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  34.38 
 
 		 365 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  34.68 
 
 		 371 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  45.04 
 
 		 346 aa  193  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  36.47 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  33.81 
 
 		 351 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6661  ABC transporter related  35.6 
 
 		 386 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  34.77 
 
 		 335 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  33.9 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  35.26 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  36.41 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  37.54 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  33.6 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  38.23 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  37.86 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  34.51 
 
 		 369 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  36.24 
 
 		 357 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  34.48 
 
 		 345 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  34.1 
 
 		 353 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  37.5 
 
 		 374 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3148  ABC transporter related  36.43 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.35193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  35.39 
 
 		 355 aa  190  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  36.08 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  35.75 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2014  ABC transporter related  40.69 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.447451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  35.44 
 
 		 366 aa  189  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  34.29 
 
 		 381 aa  189  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  34.08 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  35.73 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  35.58 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  37.73 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  35.56 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  35.82 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  37.85 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  32.33 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4984  ABC transporter related  35.34 
 
 		 358 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>