More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0478 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  100 
 
 		 360 aa  716    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  77.78 
 
 		 357 aa  545  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  75.56 
 
 		 357 aa  534  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  73.89 
 
 		 357 aa  531  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  74.72 
 
 		 359 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  74.44 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  74.17 
 
 		 364 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  71.94 
 
 		 359 aa  498  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  68.06 
 
 		 374 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  67.77 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  56.76 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  57.03 
 
 		 372 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  56.22 
 
 		 372 aa  359  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  52.17 
 
 		 368 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  49.59 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  51.9 
 
 		 370 aa  335  9e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  49.03 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  49.04 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  50.14 
 
 		 367 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  50.68 
 
 		 364 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  49.33 
 
 		 364 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.06 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  51.57 
 
 		 362 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  49.46 
 
 		 364 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 		 364 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  49.59 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  49.03 
 
 		 360 aa  319  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  48.09 
 
 		 359 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  49.04 
 
 		 361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  48.48 
 
 		 373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  51.44 
 
 		 359 aa  312  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  48.9 
 
 		 359 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  48.07 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  48.89 
 
 		 359 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  47.93 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  47.28 
 
 		 356 aa  299  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  49.35 
 
 		 380 aa  298  9e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  49 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  48.59 
 
 		 362 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  48.59 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  46.67 
 
 		 366 aa  292  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  46.43 
 
 		 359 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  46.91 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  45 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  45.66 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  46.2 
 
 		 360 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  42.66 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  39.27 
 
 		 376 aa  235  8e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  36.89 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  36.89 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  37.32 
 
 		 353 aa  202  5e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  34.79 
 
 		 389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  36.03 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  35.62 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  34.38 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  34.27 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1950  ABC transporter related  34.81 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.303388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  34.08 
 
 		 351 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6661  ABC transporter related  36.62 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  34.55 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  34.56 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  35.21 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  35.21 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  34.37 
 
 		 362 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  34.26 
 
 		 363 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  33.05 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  34.56 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  34.37 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.49 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  33.99 
 
 		 369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  37.14 
 
 		 367 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  31.93 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  33.71 
 
 		 369 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  34.27 
 
 		 369 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  34.45 
 
 		 384 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.92 
 
 		 386 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.9 
 
 		 391 aa  189  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  33.8 
 
 		 362 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  35.67 
 
 		 384 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  36.26 
 
 		 367 aa  189  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  33.7 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  33.99 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  33.06 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0640  ABC transporter related  35.01 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  33.99 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  34.64 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  33.81 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2267  ABC transporter related  34.26 
 
 		 393 aa  188  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  34.64 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  32.17 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  34.45 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  33.61 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5388  ABC transporter related  38.49 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  32.97 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  34.18 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  32.96 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4987  ABC transporter related  37.08 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.86 
 
 		 357 aa  186  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>