More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1440 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  100 
 
 		 367 aa  754    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  53.78 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  52.38 
 
 		 362 aa  388  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  53.22 
 
 		 373 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  53.35 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  52.79 
 
 		 364 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  53.37 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  52.23 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  55.34 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  50.7 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  51.69 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  52.38 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  50.84 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  51.67 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  50.84 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  52.75 
 
 		 372 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  51.94 
 
 		 370 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  52.14 
 
 		 362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  50.7 
 
 		 366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  51.79 
 
 		 372 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  51.52 
 
 		 368 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  49.31 
 
 		 362 aa  352  5.9999999999999994e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  51.37 
 
 		 364 aa  352  7e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  52.38 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  52.37 
 
 		 359 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  50.55 
 
 		 372 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  51.66 
 
 		 359 aa  347  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  50.28 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  51.14 
 
 		 359 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  50.28 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  48.64 
 
 		 374 aa  337  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  47.89 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  50.14 
 
 		 360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  49.42 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  46.74 
 
 		 358 aa  325  7e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  49.13 
 
 		 362 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  48.84 
 
 		 362 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  47.81 
 
 		 373 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  47.73 
 
 		 359 aa  319  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  46.74 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  46.61 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  47.89 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  45.87 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  45.04 
 
 		 367 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  41.19 
 
 		 376 aa  272  7e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  38.73 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  35.24 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  35.24 
 
 		 355 aa  216  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  35.08 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  33.81 
 
 		 368 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  36.22 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  36.22 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  35.49 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  35.23 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.53 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  35.91 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  36.28 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.91 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  40.34 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  31.91 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  34.76 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  33.52 
 
 		 359 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  42.91 
 
 		 365 aa  205  8e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  33.89 
 
 		 363 aa  205  9e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  35.65 
 
 		 357 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  34.69 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.65 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.43 
 
 		 358 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  40.48 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  36.76 
 
 		 367 aa  204  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  34.08 
 
 		 362 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  34.46 
 
 		 379 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  36.02 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.14 
 
 		 357 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  34.92 
 
 		 369 aa  202  7e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  34.29 
 
 		 353 aa  202  7e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.47 
 
 		 357 aa  202  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  33.72 
 
 		 357 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  36.04 
 
 		 356 aa  202  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  40.41 
 
 		 360 aa  202  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  35.91 
 
 		 367 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  35.49 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  42.15 
 
 		 346 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  33.82 
 
 		 378 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  33.52 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  37.62 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.47 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  32.32 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  42.15 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  32.23 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  35.4 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.17 
 
 		 357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  34.71 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>