More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4104 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  100 
 
 
362 aa  743    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  72.83 
 
 
362 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  72.54 
 
 
362 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  73.55 
 
 
359 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  72.83 
 
 
362 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  59.77 
 
 
360 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  59.6 
 
 
359 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  59.32 
 
 
359 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  60.63 
 
 
360 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  58.19 
 
 
359 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  60.28 
 
 
359 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  58.33 
 
 
361 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  59.15 
 
 
359 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  58.57 
 
 
356 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  56.5 
 
 
367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  56.15 
 
 
359 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  58.29 
 
 
362 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  50.28 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  50.85 
 
 
362 aa  352  5e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  49.31 
 
 
367 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  50.86 
 
 
353 aa  348  8e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  51.65 
 
 
372 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  51.79 
 
 
372 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  50 
 
 
362 aa  339  4e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  50.27 
 
 
372 aa  335  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 
364 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  50.85 
 
 
364 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  48.89 
 
 
373 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  49.05 
 
 
368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  50.97 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  48.87 
 
 
364 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  48.75 
 
 
370 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  49.16 
 
 
357 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  50.7 
 
 
364 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  49.72 
 
 
366 aa  322  5e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  48.87 
 
 
364 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  47.49 
 
 
374 aa  319  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  47.46 
 
 
364 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 
364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  48.33 
 
 
357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  46.46 
 
 
364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  50 
 
 
359 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  49.72 
 
 
359 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  47.93 
 
 
360 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  47.25 
 
 
357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  47.29 
 
 
373 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  45.68 
 
 
380 aa  282  8.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  38.92 
 
 
376 aa  264  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  36.66 
 
 
357 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  35.75 
 
 
359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  33.81 
 
 
355 aa  212  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  37.43 
 
 
378 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  37.43 
 
 
353 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  33.24 
 
 
355 aa  209  8e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  34.84 
 
 
359 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  36.52 
 
 
332 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  35.18 
 
 
386 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  37.26 
 
 
332 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  35.43 
 
 
378 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  36.31 
 
 
354 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  35.46 
 
 
384 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  35 
 
 
389 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  35.39 
 
 
384 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  35.76 
 
 
379 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  39.55 
 
 
367 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  36 
 
 
353 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 
386 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  33.51 
 
 
381 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  35.2 
 
 
336 aa  202  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  34.92 
 
 
381 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  36 
 
 
393 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
368 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  35.71 
 
 
333 aa  202  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  34.95 
 
 
386 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  34.44 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.95 
 
 
386 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  32.88 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  34.18 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  34.83 
 
 
384 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  35.36 
 
 
353 aa  200  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  37.54 
 
 
356 aa  200  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  34.36 
 
 
380 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  34.27 
 
 
363 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  34.83 
 
 
384 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  34.54 
 
 
376 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  36.79 
 
 
370 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  36.31 
 
 
363 aa  199  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  33.15 
 
 
359 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3453  ABC transporter related  33.88 
 
 
377 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919883  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  34.41 
 
 
368 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  34.36 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  34.77 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  32.45 
 
 
386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1944  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  33.71 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  34.57 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  34 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  34.26 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.28 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  34.18 
 
 
356 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  33.52 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.423857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>