More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2322 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  100 
 
 		 359 aa  719    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  82.45 
 
 		 357 aa  577  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  78.27 
 
 		 387 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  79.11 
 
 		 364 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  77.99 
 
 		 359 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  74.72 
 
 		 360 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  73.26 
 
 		 357 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  73.74 
 
 		 357 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  67.78 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  67.41 
 
 		 374 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  57.77 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  57.22 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  56.28 
 
 		 372 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  56.51 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  54.59 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  49.72 
 
 		 362 aa  348  9e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  51.66 
 
 		 367 aa  347  3e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  50.28 
 
 		 362 aa  345  8.999999999999999e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  53.54 
 
 		 362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  48.62 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  51.24 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.96 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  49.72 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  49.44 
 
 		 364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  50.69 
 
 		 364 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  49.45 
 
 		 373 aa  325  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  50.28 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  50.14 
 
 		 361 aa  319  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  50 
 
 		 359 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  50 
 
 		 364 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  49.02 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  50.28 
 
 		 359 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  50 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  52.41 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  49.58 
 
 		 359 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  51 
 
 		 362 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  49.02 
 
 		 367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  51 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  51 
 
 		 362 aa  301  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  47.92 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  46.54 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  46.42 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  47.78 
 
 		 359 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  47.86 
 
 		 360 aa  291  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  45.48 
 
 		 353 aa  292  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  46.41 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  40.34 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  36.99 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  36.71 
 
 		 355 aa  223  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  36.72 
 
 		 386 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  36.31 
 
 		 353 aa  202  7e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.67 
 
 		 391 aa  202  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.44 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4987  ABC transporter related  35.41 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  35.77 
 
 		 380 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  34.31 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  34.17 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  35.67 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  33.99 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  36.06 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.14 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  36.96 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  35.53 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  34.89 
 
 		 367 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  35.59 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  35.29 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  36.2 
 
 		 368 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  34.27 
 
 		 384 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  34.27 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  34.78 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.25 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.86 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  34.92 
 
 		 359 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  32.87 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  34.08 
 
 		 363 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  34.86 
 
 		 355 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  34.1 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  33.99 
 
 		 386 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  36.39 
 
 		 359 aa  192  8e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  35.37 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  37.07 
 
 		 359 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  35.77 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  34.75 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1655  ABC transporter related  36.24 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  35.49 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  34.52 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  36.49 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  36.09 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  35.61 
 
 		 345 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.61 
 
 		 356 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  34.33 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  33.52 
 
 		 351 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  36.89 
 
 		 359 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  34.52 
 
 		 379 aa  189  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.61 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  44.77 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  35.41 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  33.05 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>