More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2222 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  100 
 
 		 361 aa  727    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  81.84 
 
 		 359 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  80.45 
 
 		 359 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  81.01 
 
 		 359 aa  587  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  77.56 
 
 		 359 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  58.33 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  61.65 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  59.31 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  57.02 
 
 		 362 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  57.31 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  57.75 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  57.67 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  59.72 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  56.41 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  54.42 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  54.7 
 
 		 359 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  51.67 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  51.81 
 
 		 364 aa  359  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  53.54 
 
 		 359 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  52.09 
 
 		 364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  51.81 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  51.12 
 
 		 373 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.35 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  49.31 
 
 		 362 aa  346  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  51.51 
 
 		 372 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  52.08 
 
 		 364 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  52.08 
 
 		 364 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  51.8 
 
 		 364 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  51.36 
 
 		 372 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  50.14 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  49.32 
 
 		 362 aa  332  5e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  48.58 
 
 		 358 aa  328  7e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  48.45 
 
 		 353 aa  325  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  49.59 
 
 		 357 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  50.83 
 
 		 370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  50.42 
 
 		 357 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  50.14 
 
 		 359 aa  319  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  50.14 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  50 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  49.04 
 
 		 360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  48.52 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  47.77 
 
 		 366 aa  309  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  48.2 
 
 		 357 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  48.9 
 
 		 359 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  48.75 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  48.88 
 
 		 374 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 380 aa  281  9e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  41.34 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  37.22 
 
 		 352 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.62 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  35.54 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  38.55 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  34.9 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  34.6 
 
 		 374 aa  215  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 		 386 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  36.39 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  37.92 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  35.8 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  38.31 
 
 		 367 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 		 363 aa  212  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  36.46 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  38.18 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  36.6 
 
 		 389 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  35.38 
 
 		 363 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  36.13 
 
 		 366 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 370 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  36.54 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2134  ABC transporter related protein  36.18 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  35.84 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  34.64 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  34.36 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  36.6 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  34.27 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  36.78 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  33.71 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  34.54 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  33.8 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0430  ABC transporter related protein  33.88 
 
 		 359 aa  206  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.49 
 
 		 386 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.08 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.24 
 
 		 360 aa  206  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.96 
 
 		 349 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  37.54 
 
 		 368 aa  205  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  33.77 
 
 		 386 aa  205  8e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3680  ABC transporter related  37.91 
 
 		 364 aa  205  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  35.73 
 
 		 384 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  33.42 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  35.14 
 
 		 386 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0480  ABC transporter related  33.15 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  32.78 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  33.8 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  36.61 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  33.96 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  35.73 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  35.24 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  35.67 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  37.85 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  38.29 
 
 		 353 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>