More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6469 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  100 
 
 		 359 aa  733    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  92.2 
 
 		 359 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  73.3 
 
 		 356 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  73.3 
 
 		 360 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  69.49 
 
 		 367 aa  514  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  69.12 
 
 		 360 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  59.15 
 
 		 362 aa  411  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  59.77 
 
 		 362 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  59.43 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  60 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  58.55 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  58.55 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  54.93 
 
 		 359 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  55.27 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  54.7 
 
 		 359 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  54.7 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  53.28 
 
 		 359 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  50.71 
 
 		 362 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  51.12 
 
 		 358 aa  352  5e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  48.58 
 
 		 353 aa  341  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  47.66 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  50.57 
 
 		 364 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  47.81 
 
 		 372 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  47.81 
 
 		 372 aa  325  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  49.71 
 
 		 364 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  47.71 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  49.43 
 
 		 364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  47.73 
 
 		 367 aa  319  6e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  47.88 
 
 		 366 aa  318  9e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  48.9 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  49.71 
 
 		 364 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  48.14 
 
 		 364 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  48.14 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  46.74 
 
 		 364 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  44.89 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  47.73 
 
 		 370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 		 374 aa  302  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  46.7 
 
 		 357 aa  301  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  47.92 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  46.8 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  45.45 
 
 		 357 aa  298  9e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  46.26 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  45 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  45.18 
 
 		 373 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  44.01 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  35.24 
 
 		 376 aa  223  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  34.76 
 
 		 355 aa  202  5e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1207  ABC transporter related  42.48 
 
 		 342 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  34.15 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  34.72 
 
 		 367 aa  198  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  33.99 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  34.17 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  33.03 
 
 		 372 aa  195  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  33.99 
 
 		 351 aa  195  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  35.67 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  34.63 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  34.72 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  33.98 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  34.16 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  33.79 
 
 		 370 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  32.67 
 
 		 360 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.14 
 
 		 333 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  35.44 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  34.13 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  34.51 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  33.82 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  34.08 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  33.82 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1655  ABC transporter related  36.31 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  33.14 
 
 		 333 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  37.29 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  37.1 
 
 		 332 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  39.32 
 
 		 367 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2451  ABC transporter related  33.43 
 
 		 364 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  34.16 
 
 		 361 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 		 368 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  33.15 
 
 		 368 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.86 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  33.89 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0607  ABC transporter related  33.54 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0567231 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  33.82 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  34.09 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  35.47 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  34.97 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  40.91 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  31.4 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  34.44 
 
 		 332 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  35.98 
 
 		 357 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  40.91 
 
 		 346 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  33.05 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  35.85 
 
 		 370 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  36.75 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  36.75 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  34.56 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  36.75 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2014  ABC transporter related  39.84 
 
 		 362 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.447451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  32.03 
 
 		 345 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>