More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3396 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  100 
 
 		 357 aa  713    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  76.92 
 
 		 357 aa  534  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  76.64 
 
 		 357 aa  534  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  75.56 
 
 		 360 aa  534  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  73.73 
 
 		 387 aa  514  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  72.91 
 
 		 359 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  73.74 
 
 		 359 aa  512  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  74.5 
 
 		 364 aa  507  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  68.84 
 
 		 374 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  67.7 
 
 		 373 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  57.58 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  57.85 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  57.3 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  54.2 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  50.41 
 
 		 362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  50.7 
 
 		 362 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  54.95 
 
 		 370 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  52.08 
 
 		 364 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  55.71 
 
 		 362 aa  352  8e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.8 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  51.52 
 
 		 364 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  51.8 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  50.14 
 
 		 364 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  50.28 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  50.7 
 
 		 364 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  50.7 
 
 		 364 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  51.1 
 
 		 373 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  50.56 
 
 		 359 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  50.7 
 
 		 359 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  50 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  49.3 
 
 		 360 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  50.97 
 
 		 359 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  50.42 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  48.21 
 
 		 366 aa  315  7e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  48.33 
 
 		 362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  51.94 
 
 		 380 aa  312  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  48.73 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  46.88 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  46.7 
 
 		 359 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  47.85 
 
 		 362 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  48.14 
 
 		 362 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  46.81 
 
 		 359 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  48.14 
 
 		 362 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  46.7 
 
 		 360 aa  298  9e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  45.64 
 
 		 356 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  45.45 
 
 		 358 aa  282  8.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  42.69 
 
 		 353 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  39.89 
 
 		 376 aa  247  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  36.63 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  36.63 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  36.52 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  38.37 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1655  ABC transporter related  38.66 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4987  ABC transporter related  37.32 
 
 		 371 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  37.25 
 
 		 365 aa  202  5e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  38.04 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.46 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  35.64 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  35.37 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  35.56 
 
 		 381 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  36.08 
 
 		 336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  38.17 
 
 		 403 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 		 386 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  34.84 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  36.83 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  36.8 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  37.72 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  35.36 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2597  ABC transporter related  39.51 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  34.53 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  34.72 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  37.91 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  34.59 
 
 		 386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2558  ABC transporter related  39.51 
 
 		 371 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2603  ABC transporter related  39.51 
 
 		 371 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  34.47 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2293  ABC transporter-related protein  36.1 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925018  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  31.96 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  36.5 
 
 		 374 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  31.84 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  31.84 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1694  ABC transporter related  38.37 
 
 		 341 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  31.96 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  36.34 
 
 		 357 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.93 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  31.96 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  33.7 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.96 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.08 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  37.04 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  35.55 
 
 		 370 aa  193  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>