More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5367 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  100 
 
 
370 aa  741    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  83.56 
 
 
368 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  67.91 
 
 
372 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  67.38 
 
 
372 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  66.58 
 
 
372 aa  484  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  54.45 
 
 
374 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  55.4 
 
 
357 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  55.28 
 
 
359 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  55.53 
 
 
364 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  54.59 
 
 
359 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  55.59 
 
 
387 aa  363  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  51.94 
 
 
367 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  54.64 
 
 
357 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  54.7 
 
 
373 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  52.05 
 
 
357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  50.84 
 
 
362 aa  344  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  49.31 
 
 
362 aa  341  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  51.9 
 
 
360 aa  339  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  52.57 
 
 
362 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  51.71 
 
 
362 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  50.28 
 
 
362 aa  334  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  51.25 
 
 
359 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 
364 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  51.7 
 
 
362 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  50.97 
 
 
359 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  49.73 
 
 
364 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  50.42 
 
 
359 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  49.73 
 
 
364 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  52.84 
 
 
362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  50.14 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  47.4 
 
 
364 aa  326  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  51.51 
 
 
361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  48.91 
 
 
373 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  49.86 
 
 
359 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  49.05 
 
 
364 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 
364 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  48.77 
 
 
364 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  49.31 
 
 
359 aa  322  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  50 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  48.74 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  49.31 
 
 
367 aa  315  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  47.73 
 
 
359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  45.71 
 
 
360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  47.73 
 
 
359 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  48.9 
 
 
358 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  48.61 
 
 
380 aa  296  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  45.83 
 
 
353 aa  292  7e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  42.01 
 
 
376 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  37.13 
 
 
355 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  39.44 
 
 
359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  37.67 
 
 
389 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  32.5 
 
 
363 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  37.2 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  35.8 
 
 
355 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  37.06 
 
 
386 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  40.82 
 
 
360 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 
368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  36.62 
 
 
357 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  40.82 
 
 
360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  39.94 
 
 
356 aa  215  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  38.59 
 
 
355 aa  215  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  41.21 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1050  ABC transporter related  38.87 
 
 
356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125219  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  38.86 
 
 
367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
362 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  37.18 
 
 
359 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  37.12 
 
 
367 aa  212  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  37.36 
 
 
371 aa  212  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  37.14 
 
 
385 aa  212  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1944  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  38.46 
 
 
356 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  39.16 
 
 
367 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  34.26 
 
 
369 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  36.31 
 
 
368 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  37.99 
 
 
374 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 
373 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  37.65 
 
 
368 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  35.23 
 
 
372 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  33.52 
 
 
369 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  36.68 
 
 
371 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.85 
 
 
357 aa  209  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.71 
 
 
386 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  37.6 
 
 
384 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 
386 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  37.21 
 
 
361 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  43.11 
 
 
403 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  37.6 
 
 
384 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6262  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.13 
 
 
344 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.543134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  36.08 
 
 
371 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.85 
 
 
357 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  36.41 
 
 
371 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  37.5 
 
 
359 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  36.78 
 
 
384 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  35.91 
 
 
386 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.11 
 
 
372 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  40.62 
 
 
372 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  37.94 
 
 
379 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  40.07 
 
 
371 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  40.62 
 
 
372 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  37.09 
 
 
353 aa  207  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  40.07 
 
 
371 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>