More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1207 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  89.05 
 
 		 362 aa  638    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  100 
 
 		 362 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  89.63 
 
 		 362 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  79.77 
 
 		 359 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  72.1 
 
 		 362 aa  530  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  60.63 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  60.45 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  59.89 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  59.04 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  59.94 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  60.63 
 
 		 360 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  61.71 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  59.48 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  59.66 
 
 		 359 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  60.29 
 
 		 367 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  58.89 
 
 		 361 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  58.82 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  52.1 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  53.19 
 
 		 372 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  52.91 
 
 		 372 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  53.2 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  50.97 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  50 
 
 		 358 aa  343  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  53.04 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  49.58 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  50.57 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  50.28 
 
 		 353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  50.57 
 
 		 364 aa  335  7e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  52.23 
 
 		 370 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  51.14 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  49.01 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  48.21 
 
 		 367 aa  328  6e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  52.08 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 364 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  49.43 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  49.72 
 
 		 364 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  51.27 
 
 		 387 aa  318  9e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  49.29 
 
 		 374 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  47.16 
 
 		 366 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  49.44 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  49.86 
 
 		 373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  50.83 
 
 		 359 aa  309  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  51.39 
 
 		 359 aa  308  9e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  47.74 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  48.19 
 
 		 357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  49.44 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  46.65 
 
 		 380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  40.96 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  35.49 
 
 		 372 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  35.73 
 
 		 356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  34.82 
 
 		 365 aa  210  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  36.29 
 
 		 389 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  38.07 
 
 		 378 aa  209  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  35.82 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  38.75 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  36.83 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  34.47 
 
 		 355 aa  206  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  35.46 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  37.18 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  34.64 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  35.49 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  34.64 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  35.39 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  34.9 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  37.67 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  36.49 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  33.9 
 
 		 355 aa  203  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  35.75 
 
 		 384 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  35.44 
 
 		 369 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  36.03 
 
 		 384 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 		 386 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  36.89 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  34.15 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  37.08 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  34.51 
 
 		 371 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  37.36 
 
 		 332 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  35.24 
 
 		 363 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3453  ABC transporter related  35.56 
 
 		 377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  35.47 
 
 		 384 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  37.71 
 
 		 351 aa  199  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.31 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  30.92 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  33.24 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  37.29 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  35.74 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  32.7 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5705  ABC transporter related  35.29 
 
 		 366 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  35.39 
 
 		 354 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  37 
 
 		 364 aa  195  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  33.7 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  32.52 
 
 		 379 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  36.29 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  32.6 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  36.57 
 
 		 371 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  31.96 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  34.29 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  35.78 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>