More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2100 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  100 
 
 		 376 aa  772    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  42.86 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  42.58 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  41.76 
 
 		 359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  41.19 
 
 		 367 aa  272  7e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  41.19 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  41.34 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  38.92 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  40.62 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  42.33 
 
 		 362 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  41.19 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  42.01 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  39.77 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  41.09 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  40.96 
 
 		 364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  38.76 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  39.2 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  40.4 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.68 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  39.33 
 
 		 362 aa  256  6e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  38.55 
 
 		 358 aa  255  8e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  40.62 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  39.04 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  40.96 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  41.53 
 
 		 372 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  41.24 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  37.93 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  38.86 
 
 		 353 aa  249  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  39.55 
 
 		 374 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  39.89 
 
 		 357 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  39.72 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  38.29 
 
 		 367 aa  246  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  38.97 
 
 		 360 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  40.62 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  40 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  39.89 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  40.34 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  39.15 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  41.06 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  39.77 
 
 		 357 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  39.27 
 
 		 360 aa  235  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  37.78 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  39.2 
 
 		 359 aa  233  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  34.83 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  34.83 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  35.05 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  35.05 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  34.86 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  34.92 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  34.92 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  39.4 
 
 		 380 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  36.04 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  35.24 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  35.49 
 
 		 370 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  34.66 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2491  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  36.14 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2134  ABC transporter related protein  35.77 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  35.11 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.88 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  35.61 
 
 		 370 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  37.95 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  33.15 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  32.79 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  34.77 
 
 		 353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  33.67 
 
 		 431 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  32.79 
 
 		 372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  34.34 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  32.79 
 
 		 372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  36 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  32.79 
 
 		 372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  35.23 
 
 		 359 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  34.43 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 360 aa  212  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  35.23 
 
 		 366 aa  212  7.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6366  ABC transporter related  42.04 
 
 		 339 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0766362  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  33.89 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  34.09 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.09 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  33.24 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  33.8 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  34.17 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  33.97 
 
 		 385 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 380 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  34.05 
 
 		 402 aa  209  8e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.72 
 
 		 356 aa  209  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  35.28 
 
 		 370 aa  209  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6661  ABC transporter related  35 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2431  ABC transporter related  37.93 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.435131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  32.07 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  35.56 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  32.07 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  32.07 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  33.43 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  32.07 
 
 		 371 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  33.6 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  34.03 
 
 		 388 aa  206  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  32.78 
 
 		 384 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>