More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2669 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 362 aa  733    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  89.05 
 
 		 362 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  99.45 
 
 		 362 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  79.48 
 
 		 359 aa  555  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  71.82 
 
 		 362 aa  535  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  59.04 
 
 		 359 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  58.76 
 
 		 359 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  58.19 
 
 		 359 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  61.43 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  59.2 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  58.33 
 
 		 356 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  59.61 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  57.7 
 
 		 359 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  57.47 
 
 		 360 aa  401  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  58.45 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  56.74 
 
 		 361 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  57.18 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  51.26 
 
 		 362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  52.63 
 
 		 372 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  51.14 
 
 		 353 aa  348  7e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  52.92 
 
 		 372 aa  348  8e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  51.14 
 
 		 364 aa  345  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  49.03 
 
 		 362 aa  344  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  51.8 
 
 		 372 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  51.14 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  49.86 
 
 		 373 aa  343  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  49.58 
 
 		 364 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  49.72 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  50.7 
 
 		 368 aa  332  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  50.85 
 
 		 364 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  51.4 
 
 		 370 aa  332  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  49.04 
 
 		 367 aa  329  6e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  49.86 
 
 		 364 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.86 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  52.08 
 
 		 364 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  49.29 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  47.73 
 
 		 366 aa  318  7e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  50.7 
 
 		 387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  50 
 
 		 357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  50.7 
 
 		 373 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  50.96 
 
 		 359 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  48.57 
 
 		 374 aa  312  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  51.38 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  48.02 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  48.47 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  49.03 
 
 		 360 aa  300  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  47.24 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  40.91 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  34.94 
 
 		 372 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  36.84 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 		 368 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  33.71 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  34.63 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  32.87 
 
 		 365 aa  206  7e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 		 386 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  33.14 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  35.65 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 378 aa  202  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  35.47 
 
 		 384 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  34.69 
 
 		 371 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  34.2 
 
 		 351 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  37.01 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  35.2 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  34.64 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  35.36 
 
 		 381 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  34.86 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.29 
 
 		 386 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  35.47 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  38 
 
 		 367 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  35.53 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  33.72 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  36.9 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  31.89 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  34.26 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  33.8 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  35.23 
 
 		 379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  36.04 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  36.31 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  35.11 
 
 		 354 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  35.04 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  34.65 
 
 		 373 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  35.33 
 
 		 364 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  33.42 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  34.73 
 
 		 332 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  42.32 
 
 		 348 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4987  ABC transporter related  34.07 
 
 		 371 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  33.71 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  34.84 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  37.5 
 
 		 379 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  42.32 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  42.32 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  29.53 
 
 		 363 aa  192  9e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.21 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  33.03 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  34.6 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.21 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  34.06 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  32.3 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.57 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>