More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3635 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  89.84 
 
 		 364 aa  673    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  89.29 
 
 		 364 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  100 
 
 		 364 aa  742    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  82.97 
 
 		 373 aa  621  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  77.35 
 
 		 364 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  77.07 
 
 		 364 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  77.07 
 
 		 364 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  76.92 
 
 		 364 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  70.39 
 
 		 362 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  71.67 
 
 		 366 aa  509  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  63.2 
 
 		 362 aa  478  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  50.7 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  51.96 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  51.4 
 
 		 359 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  50.96 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  51.81 
 
 		 361 aa  359  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  50.41 
 
 		 372 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  49.44 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  50.14 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  49.59 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  49.03 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  50.83 
 
 		 357 aa  346  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  49.16 
 
 		 359 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  50.14 
 
 		 357 aa  342  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  48.9 
 
 		 359 aa  342  8e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  48.72 
 
 		 356 aa  338  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  48.62 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 		 362 aa  335  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  48.34 
 
 		 387 aa  335  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  49.17 
 
 		 357 aa  335  7e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  49.28 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  49.04 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  47.51 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  47.81 
 
 		 368 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  50.14 
 
 		 359 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  48.99 
 
 		 362 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  48.87 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  47.54 
 
 		 370 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  47.24 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  47.51 
 
 		 374 aa  315  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  47.51 
 
 		 373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  46.74 
 
 		 359 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  46.09 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  44.85 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  45.61 
 
 		 353 aa  302  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  46.93 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  45.33 
 
 		 367 aa  295  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  39.2 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.38 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.44 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 		 368 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  35.43 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  33.24 
 
 		 346 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 356 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  33.05 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  33.05 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.05 
 
 		 356 aa  206  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.05 
 
 		 356 aa  206  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 356 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  33.24 
 
 		 346 aa  205  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.76 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  35.87 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  33.43 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  35.54 
 
 		 355 aa  204  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.05 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  34.66 
 
 		 379 aa  203  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.05 
 
 		 356 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  32.76 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.05 
 
 		 356 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  34.35 
 
 		 377 aa  202  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.76 
 
 		 356 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  33.05 
 
 		 355 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.52 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  34.62 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  36.1 
 
 		 349 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  33.06 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  34.94 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  37.18 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.78 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1286  ABC transporter related  38.41 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  34.23 
 
 		 357 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.19 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  37.34 
 
 		 365 aa  199  6e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  32.77 
 
 		 380 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4987  ABC transporter related  33.7 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  32.34 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  33.9 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.58 
 
 		 357 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  31.82 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  35.87 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2134  ABC transporter related protein  35.26 
 
 		 368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  32.48 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2293  ABC transporter-related protein  32.88 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  32.12 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.96 
 
 		 358 aa  196  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  36.33 
 
 		 348 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  33.99 
 
 		 359 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>