More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2094 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  100 
 
 		 362 aa  737    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  69.64 
 
 		 362 aa  531  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  63.43 
 
 		 373 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  64.33 
 
 		 364 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  63.2 
 
 		 364 aa  478  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  64.04 
 
 		 364 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  64.04 
 
 		 364 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.76 
 
 		 364 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  63.76 
 
 		 364 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  63.2 
 
 		 364 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  62 
 
 		 366 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  52.38 
 
 		 367 aa  388  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  53.14 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  51.52 
 
 		 357 aa  360  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  50.41 
 
 		 357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  52.34 
 
 		 387 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  49.86 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  50.85 
 
 		 362 aa  352  5e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  53.62 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  49.59 
 
 		 372 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  50.69 
 
 		 359 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  50.72 
 
 		 359 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  50.56 
 
 		 374 aa  349  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  49.86 
 
 		 357 aa  348  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  51.72 
 
 		 362 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  50.28 
 
 		 359 aa  345  8.999999999999999e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  49.43 
 
 		 360 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  51.4 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  50.72 
 
 		 359 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  49.43 
 
 		 356 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  49.59 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  50.84 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  49.71 
 
 		 362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  48.85 
 
 		 360 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  50.14 
 
 		 359 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  49.28 
 
 		 359 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  49.71 
 
 		 362 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  49.31 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  48.75 
 
 		 368 aa  335  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  49.72 
 
 		 367 aa  335  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  49.32 
 
 		 361 aa  332  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  48.76 
 
 		 373 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  48.29 
 
 		 359 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  47.71 
 
 		 359 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  47.84 
 
 		 380 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  43.94 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  42.86 
 
 		 353 aa  285  9e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  39.33 
 
 		 376 aa  256  6e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  36.36 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  35.94 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  36.34 
 
 		 346 aa  212  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  36.34 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  36.49 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  35.53 
 
 		 367 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  32.11 
 
 		 363 aa  209  9e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  34.19 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  35.34 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  33.62 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 374 aa  206  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  34.43 
 
 		 369 aa  206  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  35.65 
 
 		 356 aa  205  8e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  35.33 
 
 		 336 aa  205  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  32.39 
 
 		 357 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  32.77 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2293  ABC transporter-related protein  32.42 
 
 		 359 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  34.16 
 
 		 367 aa  203  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  34.16 
 
 		 367 aa  203  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  34.38 
 
 		 356 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  34.46 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  34.46 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  40.62 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  33.89 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1694  hypothetical protein  33.33 
 
 		 363 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  34.18 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  33.33 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  33.89 
 
 		 371 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  34.29 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  34.77 
 
 		 377 aa  199  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  32.77 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  33.52 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  34.06 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  35 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  33.33 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1693  hypothetical protein  33.06 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  33.98 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  31.94 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.68 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  33.05 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  38 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  33.33 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  33.61 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.24 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  34.71 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  33.05 
 
 		 360 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  35.03 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  32.58 
 
 		 357 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  33.98 
 
 		 356 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  36.36 
 
 		 363 aa  194  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>