More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2042 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  100 
 
 		 373 aa  760    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  82.97 
 
 		 364 aa  621  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  82.69 
 
 		 364 aa  614  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  82.14 
 
 		 364 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  78.45 
 
 		 364 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  78.45 
 
 		 364 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  77.9 
 
 		 364 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  77.2 
 
 		 364 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  69.55 
 
 		 362 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  71.87 
 
 		 366 aa  511  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  63.43 
 
 		 362 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  53.22 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  52.16 
 
 		 372 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  51.89 
 
 		 372 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  51.12 
 
 		 361 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  49.58 
 
 		 360 aa  348  7e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  52.14 
 
 		 362 aa  347  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  50.4 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  50 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  50.82 
 
 		 359 aa  345  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  50.28 
 
 		 359 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  47.58 
 
 		 356 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 362 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  49.71 
 
 		 362 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  51.1 
 
 		 357 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  48.46 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  49.71 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  48.04 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  49.6 
 
 		 368 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  48.89 
 
 		 362 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  49.72 
 
 		 357 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  47.66 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  49.45 
 
 		 359 aa  325  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  49.59 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  48.9 
 
 		 387 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  47.63 
 
 		 359 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  49.05 
 
 		 373 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  48.91 
 
 		 370 aa  319  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  49.45 
 
 		 374 aa  318  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  48.34 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  49.44 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  47.31 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  48.48 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  45.68 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  49.03 
 
 		 380 aa  305  9.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  45.89 
 
 		 353 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  45.89 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  39.04 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.39 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  35.11 
 
 		 356 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.11 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.39 
 
 		 356 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.11 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  35.11 
 
 		 356 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.96 
 
 		 356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.83 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.96 
 
 		 356 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.11 
 
 		 356 aa  215  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  34.83 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.67 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.67 
 
 		 356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.39 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.55 
 
 		 356 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.01 
 
 		 357 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.73 
 
 		 357 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.28 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.8 
 
 		 357 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.28 
 
 		 362 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  33.43 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  35 
 
 		 357 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.17 
 
 		 358 aa  202  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  33.89 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  34.94 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  39.17 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2293  ABC transporter-related protein  35.49 
 
 		 359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.93 
 
 		 360 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  38.26 
 
 		 348 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  36.77 
 
 		 357 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  33.43 
 
 		 355 aa  199  7e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  31.65 
 
 		 360 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  31.65 
 
 		 360 aa  199  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  37.1 
 
 		 357 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  31.65 
 
 		 360 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  37.66 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.26 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.37 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  35.85 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  37.94 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  37.94 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  34.86 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  34.66 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  34.44 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  35.29 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  32.58 
 
 		 355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  34.44 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6661  ABC transporter related  34 
 
 		 386 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>