More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3046 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  100 
 
 		 372 aa  748    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  89.25 
 
 		 372 aa  667    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  89.25 
 
 		 372 aa  667    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  67.38 
 
 		 368 aa  484  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  66.04 
 
 		 370 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  59.45 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  57.72 
 
 		 373 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  57.3 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  55.34 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  57.38 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  57.02 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  56.95 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  56.2 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  56.28 
 
 		 359 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  56.22 
 
 		 360 aa  359  5e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.99 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  53.99 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  53.99 
 
 		 364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  53.67 
 
 		 362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  51.24 
 
 		 364 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  50.55 
 
 		 367 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  50.4 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  49.59 
 
 		 364 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  52.54 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  51.1 
 
 		 359 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  52.34 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  52.26 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  50.82 
 
 		 359 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  49.31 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  50.27 
 
 		 362 aa  335  7.999999999999999e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  50.82 
 
 		 359 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  50.14 
 
 		 361 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  49.86 
 
 		 362 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  49.46 
 
 		 359 aa  328  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  51.4 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  48.78 
 
 		 360 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  48.48 
 
 		 356 aa  315  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  46.77 
 
 		 366 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  50 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  47.95 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  46.2 
 
 		 359 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  44.89 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  46.49 
 
 		 367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  45.83 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  44.72 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  41.06 
 
 		 376 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  38.69 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  38.63 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  37.85 
 
 		 355 aa  222  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  37.29 
 
 		 355 aa  219  6e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  38.27 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6661  ABC transporter related  36.39 
 
 		 386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  35.29 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  39.72 
 
 		 356 aa  212  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  38.14 
 
 		 367 aa  212  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  34.53 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  38.15 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2293  ABC transporter-related protein  36.46 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  37.57 
 
 		 367 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5849  ABC transporter related  38.22 
 
 		 352 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  36.29 
 
 		 352 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  34.44 
 
 		 357 aa  209  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  37.02 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  42.01 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  35.69 
 
 		 364 aa  206  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  36.11 
 
 		 362 aa  206  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  37.36 
 
 		 381 aa  206  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  34.88 
 
 		 380 aa  205  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.16 
 
 		 356 aa  205  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  36.6 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  36.6 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  35.59 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  36.19 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  35.59 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.59 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  35.39 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  36.97 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.82 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.59 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.59 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  34.72 
 
 		 362 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5064  ABC transporter related  42.28 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5796  ABC transporter related  42.28 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.052397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  36.71 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  38.53 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  34.07 
 
 		 371 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.59 
 
 		 356 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  38.66 
 
 		 356 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4383  ABC transporter related  42.28 
 
 		 397 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0235  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.06 
 
 		 397 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  37.22 
 
 		 352 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  38.1 
 
 		 421 aa  202  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  37.5 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1654  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.06 
 
 		 397 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217926  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.59 
 
 		 356 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.72 
 
 		 357 aa  202  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  35.71 
 
 		 354 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.59 
 
 		 356 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>