More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1362 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  100 
 
 		 359 aa  728    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  84.68 
 
 		 359 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  84.12 
 
 		 359 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  83.71 
 
 		 359 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  77.56 
 
 		 361 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  62.29 
 
 		 359 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  60.23 
 
 		 362 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  57.93 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  58.21 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  56.15 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  58.97 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  56.37 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  56.34 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  54.13 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  55.65 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  53.37 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  50.84 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  53.28 
 
 		 359 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  53.26 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.53 
 
 		 364 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  52.25 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  51.97 
 
 		 364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  49.16 
 
 		 364 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  47.91 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  49.72 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  49.44 
 
 		 364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  49.28 
 
 		 362 aa  338  7e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  48.46 
 
 		 373 aa  334  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  47.44 
 
 		 353 aa  327  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  48.24 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  50.97 
 
 		 357 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  50.42 
 
 		 357 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  48.21 
 
 		 372 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  46.57 
 
 		 358 aa  316  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  49.58 
 
 		 370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  50 
 
 		 372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  48.89 
 
 		 360 aa  310  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  45.94 
 
 		 366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  49.3 
 
 		 373 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  49.16 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  48.28 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  48.31 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  48.31 
 
 		 374 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  48.18 
 
 		 359 aa  305  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  49.58 
 
 		 359 aa  305  7e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  48.44 
 
 		 387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  46.13 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  41.19 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  36.29 
 
 		 359 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  35.21 
 
 		 365 aa  212  7e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  36.58 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  35.59 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  33.61 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  34.17 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  34.17 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  32.68 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  34.25 
 
 		 369 aa  209  6e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  34.92 
 
 		 386 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  34.45 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  35.34 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.96 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  34.87 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4187  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 353 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  34.58 
 
 		 350 aa  205  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.96 
 
 		 366 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  34.76 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  32.68 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.68 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.68 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  32.68 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  34.56 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  36.31 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.68 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  32.87 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  34.27 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1694  ABC transporter related  37.54 
 
 		 341 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  33.43 
 
 		 351 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.65 
 
 		 349 aa  203  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.59 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  34.66 
 
 		 377 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  33.52 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  34.08 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  32.11 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  36.26 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  34.82 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  35.08 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  32.77 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  33.64 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  33.93 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  34.35 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  35.26 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  33.72 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  33.43 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  34.45 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  34.08 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  35.06 
 
 		 352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>