More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2234 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 374 aa  739    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  78.71 
 
 		 373 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  69.75 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  70.19 
 
 		 359 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  68.84 
 
 		 357 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  68.06 
 
 		 360 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  68.52 
 
 		 387 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  66.39 
 
 		 357 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  67.41 
 
 		 359 aa  464  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  69.47 
 
 		 364 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  55.8 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  55.53 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  54.45 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  55.68 
 
 		 368 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  55.34 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  55.11 
 
 		 362 aa  359  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  50.56 
 
 		 362 aa  349  5e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  49.17 
 
 		 362 aa  342  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  48.64 
 
 		 367 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  50.28 
 
 		 364 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  48.47 
 
 		 359 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  49.03 
 
 		 359 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  48.03 
 
 		 360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  47.49 
 
 		 362 aa  319  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  49.45 
 
 		 373 aa  318  9e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  49.03 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  50.72 
 
 		 359 aa  315  8e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  47.51 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  48.22 
 
 		 364 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  49.16 
 
 		 364 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  49.14 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  46.57 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  46.94 
 
 		 366 aa  310  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  48.61 
 
 		 364 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  48.41 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  48.13 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  46.65 
 
 		 359 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  48.31 
 
 		 359 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  48.88 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  46.09 
 
 		 359 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  46 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  45.69 
 
 		 360 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  50.14 
 
 		 380 aa  299  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  42.62 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  42.7 
 
 		 353 aa  271  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  39.55 
 
 		 376 aa  248  9e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  37.01 
 
 		 355 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  37.01 
 
 		 355 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  36.9 
 
 		 359 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.14 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  36.86 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  37.71 
 
 		 367 aa  209  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  34.64 
 
 		 389 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  38.48 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  36.06 
 
 		 359 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  36.52 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  35.42 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  36.52 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4984  ABC transporter related  36.18 
 
 		 358 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  35.53 
 
 		 353 aa  206  6e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 386 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  37.78 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  36.13 
 
 		 365 aa  203  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  33.99 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  34.37 
 
 		 369 aa  202  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  35.9 
 
 		 352 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  37.94 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  39.22 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2293  ABC transporter-related protein  35.21 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  33.59 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0640  ABC transporter related  34.92 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  32.77 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0077  ABC sugar transporter, ATPase subunit  34.01 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  34.37 
 
 		 351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  34.67 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5863  ABC transporter related  37.68 
 
 		 358 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0374119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0630  ABC transporter related  34.38 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  35.51 
 
 		 359 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  35.49 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  36.5 
 
 		 386 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  35.45 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  36.47 
 
 		 357 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  33.97 
 
 		 386 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1481  ABC transporter related  35.34 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00851578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  32.87 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.69 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  35.24 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  35.24 
 
 		 384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  33.15 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  33.24 
 
 		 371 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  35.59 
 
 		 360 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  33.23 
 
 		 370 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0844  ABC transporter related protein  33.43 
 
 		 362 aa  196  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1944  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 356 aa  195  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  35.93 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>