More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6729 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  100 
 
 		 368 aa  739    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  83.56 
 
 		 370 aa  607  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  67.38 
 
 		 372 aa  484  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  67.11 
 
 		 372 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  66.84 
 
 		 372 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  55.68 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  57.07 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  55.19 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  56.4 
 
 		 373 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  56.51 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  54.76 
 
 		 364 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  54.2 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  54.6 
 
 		 387 aa  356  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  51.52 
 
 		 367 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  52.08 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  52.17 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  49.73 
 
 		 362 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  53.67 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  48.75 
 
 		 362 aa  335  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  52.82 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  49.6 
 
 		 373 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  49.86 
 
 		 364 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.86 
 
 		 364 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  51.57 
 
 		 362 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  51.28 
 
 		 362 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  49.58 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  49.05 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  49.45 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  49.45 
 
 		 364 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  49.17 
 
 		 359 aa  325  7e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  47.81 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  49.59 
 
 		 364 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  48.62 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  48.07 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  47.67 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  48.22 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  48.52 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  48.28 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  48.72 
 
 		 360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.77 
 
 		 367 aa  302  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  47.37 
 
 		 359 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  47.79 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  46.26 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  45.05 
 
 		 356 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  46.35 
 
 		 360 aa  288  9e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  45.28 
 
 		 353 aa  282  7.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  39.72 
 
 		 376 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  39.59 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  39.59 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  33.24 
 
 		 363 aa  219  5e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  37.47 
 
 		 381 aa  219  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  38.16 
 
 		 359 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  34.17 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.01 
 
 		 357 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  33.7 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 		 386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  38.46 
 
 		 385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.61 
 
 		 357 aa  215  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  39.94 
 
 		 356 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  35.68 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  39.07 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  37.12 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2293  ABC transporter-related protein  36.29 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  35.5 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  38.48 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  35.73 
 
 		 345 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  35.21 
 
 		 355 aa  210  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  38.25 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  35.26 
 
 		 373 aa  209  6e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  38.25 
 
 		 367 aa  208  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  38.37 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  36.29 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.96 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  39.05 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  37.01 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1050  ABC transporter related  38.63 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  38.92 
 
 		 357 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  35.85 
 
 		 382 aa  206  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  36.31 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  34.25 
 
 		 368 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  34.72 
 
 		 361 aa  205  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  38.46 
 
 		 367 aa  205  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  38.24 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.29 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  36.76 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  36.08 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  36.2 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  36.73 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  35.59 
 
 		 357 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  36.23 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  34.87 
 
 		 364 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  39.68 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1944  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  37.32 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  36.24 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.4 
 
 		 360 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  35.83 
 
 		 380 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  32.12 
 
 		 360 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  32.12 
 
 		 360 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  32.12 
 
 		 360 aa  202  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>