More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2417 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  100 
 
 		 358 aa  733    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  73.03 
 
 		 353 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  51.69 
 
 		 360 aa  361  9e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  51.27 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  50.28 
 
 		 362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  51.12 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  49.86 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  49.72 
 
 		 367 aa  342  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  51.15 
 
 		 359 aa  342  8e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  50.57 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  50.57 
 
 		 362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  50.29 
 
 		 362 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  48.73 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  50.28 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  48.29 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  48.58 
 
 		 361 aa  328  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  47.43 
 
 		 359 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  48.29 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  50.55 
 
 		 372 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  46.74 
 
 		 367 aa  325  7e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  49.86 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  46.57 
 
 		 359 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  46.13 
 
 		 362 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 		 364 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  46.78 
 
 		 364 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  45.68 
 
 		 373 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  46.63 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  47.95 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.35 
 
 		 364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  46.52 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  46.35 
 
 		 364 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  43.94 
 
 		 362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  44.85 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  47.79 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  47.11 
 
 		 357 aa  298  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  48.9 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  46.41 
 
 		 359 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  46.37 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  45.66 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  46.54 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  45.45 
 
 		 357 aa  282  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  46.06 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  45.25 
 
 		 387 aa  275  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  44.51 
 
 		 359 aa  275  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  43.54 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  43.73 
 
 		 373 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  38.55 
 
 		 376 aa  255  7e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 		 386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  36.34 
 
 		 389 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0430  ABC transporter related protein  33.15 
 
 		 359 aa  215  8e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  35.88 
 
 		 332 aa  215  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  36.06 
 
 		 373 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  33.88 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  35.15 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  40.19 
 
 		 353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  36.34 
 
 		 357 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  34.71 
 
 		 359 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  35.36 
 
 		 359 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  35.33 
 
 		 370 aa  210  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  34.44 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  35.08 
 
 		 376 aa  209  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  35.13 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 		 357 aa  209  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  34.05 
 
 		 381 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  34.81 
 
 		 380 aa  208  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  37.2 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  36.93 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.94 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.9 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.64 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  35.16 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  38.24 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0640  ABC transporter related  32.81 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  34.7 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  34.32 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  37.2 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.57 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  36.86 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  36.06 
 
 		 332 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  35.31 
 
 		 332 aa  205  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  34.83 
 
 		 357 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  33.6 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  37.54 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  37.1 
 
 		 360 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  36.81 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.28 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  34.71 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  34.43 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  33.92 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  34.17 
 
 		 336 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.63 
 
 		 352 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  35.52 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  34.07 
 
 		 357 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  36.62 
 
 		 355 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.28 
 
 		 357 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.28 
 
 		 357 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  33.7 
 
 		 369 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  43.04 
 
 		 346 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  33.61 
 
 		 345 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>