More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5936 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  100 
 
 		 380 aa  758    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  53.01 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  50.83 
 
 		 367 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  49.87 
 
 		 372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  49.35 
 
 		 372 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  47.84 
 
 		 362 aa  339  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  52.08 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  52.08 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  51.94 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  47.76 
 
 		 364 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  49.03 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  52.79 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  47.27 
 
 		 372 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  47.23 
 
 		 364 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  47.49 
 
 		 364 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  45.53 
 
 		 362 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  47.23 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  50.55 
 
 		 373 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  46.93 
 
 		 364 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  46.92 
 
 		 359 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  47.49 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  50.14 
 
 		 374 aa  322  9.000000000000001e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  49.35 
 
 		 360 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  50.96 
 
 		 364 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  50.83 
 
 		 359 aa  319  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  48.76 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  45.68 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  47.03 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.21 
 
 		 367 aa  315  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  45.68 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  48.33 
 
 		 370 aa  311  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  46.13 
 
 		 359 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  44.94 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  46.37 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  46.65 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  45.68 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  45.21 
 
 		 361 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  46.06 
 
 		 358 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  47.66 
 
 		 359 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  47.24 
 
 		 362 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  47.24 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  42.98 
 
 		 359 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  43.26 
 
 		 359 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  43.82 
 
 		 360 aa  285  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  44.57 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  39.4 
 
 		 376 aa  248  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  34.58 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5438  ABC transporter related protein  37.87 
 
 		 369 aa  219  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  34.32 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  37.6 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  36.44 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  37.17 
 
 		 384 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 		 368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  38.86 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  41.34 
 
 		 352 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  38.21 
 
 		 381 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  37.5 
 
 		 384 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  40 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  36.68 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  35.88 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  38.2 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  46.09 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  36.68 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 363 aa  210  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  45.2 
 
 		 346 aa  209  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  36.78 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  33.69 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  45.68 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  45.68 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  45.2 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2293  ABC transporter-related protein  38.72 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  38.51 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  37.53 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  38.03 
 
 		 357 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  37.5 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  36.21 
 
 		 356 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  36.96 
 
 		 345 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 		 363 aa  206  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  35.57 
 
 		 362 aa  205  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  36.17 
 
 		 356 aa  205  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  36.24 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  37.57 
 
 		 350 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  37.57 
 
 		 350 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  36.87 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  37.57 
 
 		 350 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.63 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  36.58 
 
 		 392 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  35.5 
 
 		 366 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  36.81 
 
 		 373 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  35.65 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  36.04 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  39.25 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  34.86 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  39.07 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  37.81 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>