More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5982 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  92.2 
 
 		 359 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  100 
 
 		 359 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  73.01 
 
 		 356 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  72.73 
 
 		 360 aa  519  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  69.21 
 
 		 367 aa  508  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  68.8 
 
 		 360 aa  508  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  60.28 
 
 		 362 aa  420  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  58.92 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  59.54 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  59.2 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  56.94 
 
 		 362 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  57.27 
 
 		 362 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  55.21 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  54.93 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  54.37 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  53.26 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  53.54 
 
 		 361 aa  359  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  50.28 
 
 		 362 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  49.86 
 
 		 358 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  47.73 
 
 		 353 aa  334  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  48.29 
 
 		 362 aa  326  5e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  50.7 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  48.36 
 
 		 372 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  47.63 
 
 		 373 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  48.36 
 
 		 372 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  49.58 
 
 		 364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 		 364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  49.58 
 
 		 364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  46.61 
 
 		 367 aa  316  4e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  46.8 
 
 		 366 aa  315  5e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  48.48 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  49 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  46.09 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  47.03 
 
 		 364 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  46.65 
 
 		 374 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  46.2 
 
 		 372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  47.73 
 
 		 370 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  47.37 
 
 		 368 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  47.49 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  47.65 
 
 		 357 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  46.81 
 
 		 357 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  47.78 
 
 		 359 aa  295  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  46.43 
 
 		 360 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  45.73 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  44.85 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  43.26 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  34.86 
 
 		 376 aa  226  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  34.35 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  33.74 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  34.56 
 
 		 336 aa  199  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  34.9 
 
 		 359 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  33.98 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1207  ABC transporter related  37.3 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  34.95 
 
 		 370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  32.87 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  34.84 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  32.87 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 		 370 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  31.95 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  35 
 
 		 370 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  37.62 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  34.35 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  36.77 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  34.38 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  35.76 
 
 		 379 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  34.45 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  34.52 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  34.38 
 
 		 332 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  36.45 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  33.62 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  34.64 
 
 		 351 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  32.68 
 
 		 365 aa  192  8e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  35.47 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  34.33 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  33.88 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  35.98 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  32.01 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  34.45 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  40.98 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  34.63 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  34.24 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  34.56 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  32.27 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2451  ABC transporter related  34.01 
 
 		 364 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  32.27 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  36.83 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  33.71 
 
 		 378 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.37 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  34.63 
 
 		 395 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  34.94 
 
 		 354 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  32.86 
 
 		 333 aa  189  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  33.33 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  40.91 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  35.33 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  33.9 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  32.48 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  33.7 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  31.82 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  33.81 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>