More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4392 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  100 
 
 		 359 aa  727    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  79.71 
 
 		 362 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  79.42 
 
 		 362 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  79.71 
 
 		 362 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  72.5 
 
 		 362 aa  530  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  63.07 
 
 		 359 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  62.25 
 
 		 359 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  61.08 
 
 		 359 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  61.36 
 
 		 359 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  61.65 
 
 		 367 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  61.58 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  60.29 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  60.29 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  61.89 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  59.43 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  60 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  59.2 
 
 		 359 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  53.62 
 
 		 362 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  52.68 
 
 		 362 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  50.55 
 
 		 367 aa  345  6e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  51.88 
 
 		 353 aa  342  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  51.15 
 
 		 358 aa  342  8e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  50.54 
 
 		 372 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  51.78 
 
 		 372 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  53.31 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.74 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  52.74 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  49.19 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  52.45 
 
 		 364 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  51.14 
 
 		 364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  51.14 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  48.9 
 
 		 368 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  50 
 
 		 364 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  50.86 
 
 		 357 aa  323  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  49.31 
 
 		 370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  53.69 
 
 		 364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  49.3 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  50.42 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  50.42 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  52.91 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  48.21 
 
 		 357 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  52.79 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  51.44 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  47.99 
 
 		 357 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  49.72 
 
 		 359 aa  298  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  47.94 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 380 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  41.09 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  32.86 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  32.29 
 
 		 355 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  36.66 
 
 		 389 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4987  ABC transporter related  35.21 
 
 		 371 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  37.71 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  36.56 
 
 		 384 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  36.29 
 
 		 384 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  36.29 
 
 		 384 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  35.92 
 
 		 351 aa  202  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  35.75 
 
 		 352 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  36.08 
 
 		 371 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  35.77 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  35.83 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  34.97 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  35.62 
 
 		 369 aa  199  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  34.58 
 
 		 345 aa  199  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  35.2 
 
 		 359 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  33.33 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  34.09 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  33.33 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  34.39 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  35.38 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  38.59 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  36.02 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 		 368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  36.75 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  34.46 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  37.5 
 
 		 367 aa  196  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  34.27 
 
 		 363 aa  196  6e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  33.33 
 
 		 370 aa  196  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  33.89 
 
 		 372 aa  195  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  35.08 
 
 		 386 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  32.63 
 
 		 425 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  33.99 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  34.97 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3680  ABC transporter related  36.44 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 		 381 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  34.96 
 
 		 356 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  33.52 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  34.41 
 
 		 368 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  36.22 
 
 		 386 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  35.08 
 
 		 371 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  34.04 
 
 		 357 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2238  ABC transporter related protein  41.73 
 
 		 384 aa  192  7e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1694  ABC transporter related  36.73 
 
 		 341 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  32.7 
 
 		 369 aa  192  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6661  ABC transporter related  36.34 
 
 		 386 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  32.22 
 
 		 365 aa  192  9e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1743  ABC-type sugar transport systems, ATPase components  37.22 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0993542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>