More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3676 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  100 
 
 		 357 aa  721    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  76.47 
 
 		 357 aa  542  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  74.93 
 
 		 387 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  73.89 
 
 		 360 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  76.64 
 
 		 357 aa  534  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  73.26 
 
 		 359 aa  517  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  71.47 
 
 		 359 aa  508  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  72.98 
 
 		 364 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  66.02 
 
 		 373 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  66.39 
 
 		 374 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  57.34 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  56.79 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  56.2 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  52.05 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  52.08 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  50 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  49.86 
 
 		 362 aa  348  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  50.28 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  51.71 
 
 		 362 aa  339  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  49.17 
 
 		 364 aa  335  7e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  50 
 
 		 364 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  50.56 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.72 
 
 		 364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  49.31 
 
 		 364 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  49.44 
 
 		 364 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  47.41 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  48.34 
 
 		 373 aa  317  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  47.75 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  48.31 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  51.06 
 
 		 380 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  48.06 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  48.32 
 
 		 366 aa  309  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  48.2 
 
 		 361 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  48.31 
 
 		 359 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  47.25 
 
 		 362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  48.14 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  48.14 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  47.85 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  47.99 
 
 		 359 aa  299  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  44.86 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  44.85 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  44.25 
 
 		 356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  44.01 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  43.91 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  43.54 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  42.53 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  39.77 
 
 		 376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  36.31 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  36.02 
 
 		 355 aa  215  8e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  37.75 
 
 		 353 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  35.21 
 
 		 355 aa  205  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  35.43 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.43 
 
 		 391 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  33.62 
 
 		 363 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 		 368 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  35.73 
 
 		 353 aa  199  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  34.36 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  33.61 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  35.77 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  35.65 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  35.06 
 
 		 356 aa  195  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  34.64 
 
 		 389 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  33.52 
 
 		 366 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  33.24 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  35.49 
 
 		 362 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  34.08 
 
 		 381 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  34.16 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.03 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 		 386 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  35.63 
 
 		 356 aa  192  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.94 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  35.45 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2094  ABC transporter related  35.63 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  34.75 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  36.61 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  33.52 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  34.18 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  34.37 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  34.93 
 
 		 360 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2558  ABC transporter related  36.66 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2597  ABC transporter related  36.66 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2603  ABC transporter related  36.66 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  34.37 
 
 		 384 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  34.37 
 
 		 384 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  34.58 
 
 		 367 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4987  ABC transporter related  35.88 
 
 		 371 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  33.91 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  36.87 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  35.03 
 
 		 369 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  32.11 
 
 		 365 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  36.29 
 
 		 379 aa  189  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  33.33 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  34.27 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  33.8 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0630  ABC transporter related  33.24 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  34.58 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>