More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0604 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0604  ABC transporter-related protein  100 
 
 
359 aa  714    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1025  ABC transporter related  80.66 
 
 
387 aa  566  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0375  ABC transporter related  79.94 
 
 
364 aa  553  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0384  ABC transporter related  77.99 
 
 
357 aa  552  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2322  ABC transporter related  77.99 
 
 
359 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.413523  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3396  ABC transporter related  72.91 
 
 
357 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3676  ABC transporter related  71.47 
 
 
357 aa  508  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0222357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0478  ABC transporter related  71.94 
 
 
360 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0124436  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2234  ABC transporter-related protein  70.19 
 
 
374 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2209  ABC transporter related  69.53 
 
 
373 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2981  ABC transporter related  59.62 
 
 
372 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.710086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3328  ABC transporter related  59.08 
 
 
372 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422123  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6729  ABC transporter related  57.07 
 
 
368 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3046  putative sugar-phosphate ATP-binding ABC transporter protein  57.38 
 
 
372 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.512316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5367  ABC transporter related  55.28 
 
 
370 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675809 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2094  ABC transporter related  50.69 
 
 
362 aa  352  8e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1440  ABC transporter related  52.37 
 
 
367 aa  350  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0312892  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0380  ABC transporter related  49.72 
 
 
362 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426662  normal  0.270823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2042  ABC transporter related  50.82 
 
 
373 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.820426  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1974  ABC transporter related  54.29 
 
 
362 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3635  ABC transporter-like  48.9 
 
 
364 aa  342  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3740  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
364 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0316158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1737  ABC transporter  50 
 
 
364 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1893  ABC transporter related  49.45 
 
 
364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3478  ABC transporter related  49.17 
 
 
364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665617  normal  0.0613026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2260  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 
364 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1733  ABC transporter related  49.45 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.657107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  48.88 
 
 
359 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3174  ABC transporter for sugar (glycerol) ATP-binding protein  47.08 
 
 
366 aa  316  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4894  ABC transporter related  48.31 
 
 
359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4104  ABC transporter related  49.72 
 
 
362 aa  310  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.315387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2222  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  48.9 
 
 
361 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2669  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  50.57 
 
 
362 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1362  ABC transporter related  48.18 
 
 
359 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1326  ABC transporter related  50.57 
 
 
362 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4216  ABC transporter related  48.88 
 
 
359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1207  ABC transporter related  50.43 
 
 
362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5982  ABC transporter related  47.49 
 
 
359 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925238  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6469  ABC transporter related  46.8 
 
 
359 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190233  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4392  ABC transporter related  49.58 
 
 
359 aa  298  8e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0095  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.14 
 
 
367 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1592  ABC transporter related  48.91 
 
 
360 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5936  ABC transporter related protein  49.59 
 
 
380 aa  296  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116552  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2904  ABC transporter related  45.69 
 
 
356 aa  292  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528485  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3977  ABC transporter related  51.28 
 
 
360 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2417  ABC transporter related  44.51 
 
 
358 aa  275  8e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0208356  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3128  sugar ABC transporter  44.19 
 
 
353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2100  ABC transporter related  39.2 
 
 
376 aa  233  6e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  36.1 
 
 
355 aa  222  9e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  36.1 
 
 
355 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.93 
 
 
391 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  36.68 
 
 
355 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.72 
 
 
357 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 
368 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  37.86 
 
 
357 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.88 
 
 
357 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  39.71 
 
 
379 aa  203  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  35.85 
 
 
365 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  36.11 
 
 
380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  36.03 
 
 
377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  35.73 
 
 
355 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  38.76 
 
 
353 aa  199  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  36.48 
 
 
359 aa  199  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  36.34 
 
 
362 aa  199  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  37.54 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1669  ABC transporter related  34.92 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  36.22 
 
 
371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  37.54 
 
 
346 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  38.17 
 
 
359 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  34.65 
 
 
361 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
375 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1183  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.71 
 
 
392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0969985  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  36.54 
 
 
371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  38.14 
 
 
360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1086  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  36.18 
 
 
357 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
386 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  36.62 
 
 
368 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  35.75 
 
 
359 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  34.91 
 
 
364 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1655  ABC transporter related  36.09 
 
 
361 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.9 
 
 
356 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.9 
 
 
356 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  35.67 
 
 
386 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  39.1 
 
 
359 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.9 
 
 
356 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  39.1 
 
 
356 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  35.65 
 
 
352 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.9 
 
 
356 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  34.71 
 
 
366 aa  193  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  34.78 
 
 
353 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  34.35 
 
 
371 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  39.56 
 
 
357 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  36.71 
 
 
353 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  32.87 
 
 
369 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  37.82 
 
 
365 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  33.9 
 
 
365 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  34.86 
 
 
371 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  39.94 
 
 
373 aa  192  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>