More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1183 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1183  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 392 aa  787    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0969985  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1086  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  99.74 
 
 		 392 aa  786    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1669  ABC transporter related  92.86 
 
 		 392 aa  717    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1770  ABC transporter related  61.56 
 
 		 405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0636101  decreased coverage  0.00357448 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0640  ABC transporter related  48.4 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0177  ABC transporter related  46.65 
 
 		 385 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3148  ABC transporter related  44.9 
 
 		 384 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.35193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0132  ABC transporter related  44.08 
 
 		 384 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143102  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  46.4 
 
 		 361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  46.28 
 
 		 361 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.06 
 
 		 375 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.37 
 
 		 391 aa  312  6.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  43.47 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  48.48 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  43.38 
 
 		 365 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7593  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.86 
 
 		 397 aa  288  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  43.38 
 
 		 368 aa  288  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  41.47 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  42.71 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  42.39 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.54 
 
 		 349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  41.3 
 
 		 369 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  42.71 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  41.8 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  43.32 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.89 
 
 		 362 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  46.06 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  43.5 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  41.02 
 
 		 373 aa  279  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  45.85 
 
 		 380 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  44.71 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  40.63 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  43.38 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  41.86 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3448  ABC transporter related  42.05 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  41.38 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  40.21 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0430  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  45.01 
 
 		 355 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  42.86 
 
 		 355 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  42.82 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  46.99 
 
 		 362 aa  276  5e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  40.84 
 
 		 369 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  45.35 
 
 		 364 aa  276  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  45.03 
 
 		 360 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  40.73 
 
 		 372 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  42.71 
 
 		 367 aa  275  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  40.62 
 
 		 380 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  45.91 
 
 		 363 aa  275  8e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  43.84 
 
 		 332 aa  275  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  41.86 
 
 		 369 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  42.38 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  42.55 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  42.02 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  41.07 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.82 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  43.09 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.8 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0064  ABC transporter related  39.34 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  44.57 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.6 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4187  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.75 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  40.85 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.24 
 
 		 352 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  41.51 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  45.06 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  40.63 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  40.63 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  42.06 
 
 		 353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.16 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  43.14 
 
 		 366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  44.57 
 
 		 382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  40.51 
 
 		 369 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  43.93 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  43.97 
 
 		 330 aa  273  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  43.93 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  48.04 
 
 		 393 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  39.59 
 
 		 386 aa  272  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.55 
 
 		 349 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.63 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.95 
 
 		 356 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.63 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  43.93 
 
 		 377 aa  273  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  43.93 
 
 		 405 aa  272  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  44.88 
 
 		 377 aa  272  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  41.34 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  43.32 
 
 		 373 aa  272  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.53 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  41.62 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1103  ABC transporter related  42.01 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  43.42 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  42.63 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.26 
 
 		 361 aa  272  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.66 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  43.97 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.63 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.63 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>