More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3148 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0177  ABC transporter related  88.31 
 
 		 385 aa  680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3148  ABC transporter related  100 
 
 		 384 aa  762    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.35193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0132  ABC transporter related  74.22 
 
 		 384 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0640  ABC transporter related  49.73 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.16 
 
 		 375 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1669  ABC transporter related  46.58 
 
 		 392 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1183  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.9 
 
 		 392 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0969985  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1086  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.9 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1770  ABC transporter related  48.53 
 
 		 405 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0636101  decreased coverage  0.00357448 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.68 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  46.77 
 
 		 334 aa  308  6.999999999999999e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  46.43 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  45.21 
 
 		 332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  47.55 
 
 		 338 aa  307  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  46.95 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7593  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.65 
 
 		 397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  47.87 
 
 		 353 aa  305  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  46.32 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  46.56 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  45.32 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  46.89 
 
 		 368 aa  302  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  45.72 
 
 		 352 aa  302  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  43.85 
 
 		 378 aa  302  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  46.99 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 357 aa  300  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2542  putative maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK  47.29 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  45.99 
 
 		 361 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  44.79 
 
 		 377 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  47.06 
 
 		 354 aa  299  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  46.92 
 
 		 386 aa  299  7e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 393 aa  298  9e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.95 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  44.74 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.48 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  46.13 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.09 
 
 		 357 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.95 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  46.61 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  45.5 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  48.51 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.09 
 
 		 357 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.49 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.42 
 
 		 351 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  47.73 
 
 		 332 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  44.85 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.97 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  46.42 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  44.05 
 
 		 391 aa  296  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.83 
 
 		 357 aa  296  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  44.89 
 
 		 334 aa  296  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  48.04 
 
 		 332 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  45.43 
 
 		 354 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.77 
 
 		 358 aa  295  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  48.96 
 
 		 325 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.97 
 
 		 349 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  46.07 
 
 		 356 aa  295  9e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  45.72 
 
 		 354 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  45.28 
 
 		 333 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  46.49 
 
 		 361 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  51.71 
 
 		 352 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  48.04 
 
 		 332 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1445  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 367 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  44.92 
 
 		 353 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  44.39 
 
 		 359 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  44.95 
 
 		 357 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  47.73 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  45.82 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  44.89 
 
 		 380 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  46.76 
 
 		 377 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  49.42 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.73 
 
 		 369 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  43.83 
 
 		 342 aa  293  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  47.52 
 
 		 325 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  44.3 
 
 		 391 aa  292  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  46.39 
 
 		 361 aa  292  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  45.19 
 
 		 353 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  44.47 
 
 		 357 aa  291  9e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  46.51 
 
 		 351 aa  291  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  44.65 
 
 		 361 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  42.93 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  45.55 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  48.05 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  42.67 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  46.34 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  47.59 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  45.03 
 
 		 363 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  45.69 
 
 		 356 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.97 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  44.29 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  49.4 
 
 		 345 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.24 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  46.36 
 
 		 357 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  45.57 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  45.09 
 
 		 357 aa  289  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  45.53 
 
 		 355 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.24 
 
 		 365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  44.68 
 
 		 352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  46.26 
 
 		 354 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  43.16 
 
 		 342 aa  289  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>