More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2014 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2014  ABC transporter related  100 
 
 		 362 aa  726    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.447451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2161  ABC transporter related  54.4 
 
 		 372 aa  346  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0486311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3228  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.08 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0207123  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2569  ABC transporter related  50.28 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  38.42 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  38.67 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  37.87 
 
 		 371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4985  ABC transporter related  37.74 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  41.81 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  41.78 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  41.46 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  37.6 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  37.6 
 
 		 371 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  39.38 
 
 		 363 aa  232  6e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6630  ABC transporter related  41.46 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.1 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.51 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  37.39 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  35.07 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  37.33 
 
 		 371 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  37.39 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  35.36 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  36.63 
 
 		 369 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.01 
 
 		 362 aa  229  6e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.58 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.33 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.33 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  39.8 
 
 		 370 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  37.54 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  37.54 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  34.93 
 
 		 358 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.53 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  35.92 
 
 		 369 aa  226  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.77 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  36.76 
 
 		 369 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  36.94 
 
 		 352 aa  225  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.63 
 
 		 357 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.63 
 
 		 357 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  37.16 
 
 		 372 aa  225  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.63 
 
 		 358 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  36.19 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  37.24 
 
 		 369 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  40.62 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  36.14 
 
 		 351 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  37.5 
 
 		 369 aa  224  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  40.21 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  37.74 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  37.84 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  35 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.37 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  39.79 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  37.96 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  37.81 
 
 		 359 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  40.69 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  40.21 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  35.75 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  37.95 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  35.87 
 
 		 355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  35.62 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  35.99 
 
 		 357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  39.68 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  35.9 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  40.77 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.58 
 
 		 357 aa  222  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  40.79 
 
 		 359 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  36.16 
 
 		 369 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  37.16 
 
 		 360 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  35.95 
 
 		 369 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  35.79 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  40.97 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  40.59 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  41.69 
 
 		 365 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  37.16 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  40.27 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  44 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  41.03 
 
 		 357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.51 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  36.97 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1103  ABC transporter related  43.21 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  35.91 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  37.24 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  34.94 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.32 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  38.01 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  39.88 
 
 		 362 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  37.88 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.44 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  38.83 
 
 		 369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.37 
 
 		 357 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  38.83 
 
 		 369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  38.01 
 
 		 360 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  38.83 
 
 		 369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.44 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  37.97 
 
 		 367 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  36.75 
 
 		 364 aa  219  5e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.46 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  40.69 
 
 		 367 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>