152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1354 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1354  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 489 aa  1003    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00427264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1779  hypothetical protein  34.85 
 
 		 464 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0201649  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  28.95 
 
 		 717 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  39.29 
 
 		 1059 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  25.11 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.19 
 
 		 588 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  26.2 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  25.64 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  24.4 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3384  WD40 domain protein beta Propeller  24.9 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.749473  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  26.32 
 
 		 629 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  26.99 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  26.07 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  26.04 
 
 		 437 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  24.4 
 
 		 434 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  24.19 
 
 		 449 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  25.64 
 
 		 450 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  26.55 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  24.8 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  24.53 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  34.31 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  25.12 
 
 		 450 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  25.21 
 
 		 449 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  25.21 
 
 		 450 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.21 
 
 		 298 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  25.14 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  25.64 
 
 		 444 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  22.7 
 
 		 448 aa  53.9  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  25.64 
 
 		 444 aa  53.9  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  25.64 
 
 		 444 aa  53.9  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1042 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  23.96 
 
 		 427 aa  53.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  27.27 
 
 		 442 aa  53.5  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  23.11 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  29.86 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  24.05 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  25.47 
 
 		 774 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  24.11 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  23.11 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  26.38 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  26.63 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  27.14 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  25.53 
 
 		 440 aa  51.6  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25 
 
 		 444 aa  50.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  27.27 
 
 		 1005 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  23.92 
 
 		 441 aa  50.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  24.52 
 
 		 461 aa  50.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  23.75 
 
 		 354 aa  50.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  24.73 
 
 		 439 aa  50.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.27 
 
 		 445 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  24.71 
 
 		 415 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  25.13 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  23.32 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  26.7 
 
 		 618 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.29 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  22.75 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.51 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  25.45 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  24.34 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  24.41 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  25.99 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.19 
 
 		 661 aa  49.3  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  25.26 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  25.99 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  24.54 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  25.99 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  23.04 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  25.99 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  24.49 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  22.87 
 
 		 1042 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  26.99 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  25.26 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  24.43 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  25 
 
 		 1111 aa  48.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  30.63 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.85 
 
 		 429 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  23.23 
 
 		 416 aa  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 442 aa  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.32 
 
 		 362 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  30.63 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  24.2 
 
 		 432 aa  47.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  26.9 
 
 		 443 aa  47.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  28 
 
 		 423 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.5 
 
 		 651 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  28 
 
 		 433 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  24.74 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  25 
 
 		 439 aa  47  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  28 
 
 		 423 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  21.96 
 
 		 446 aa  47  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  26.24 
 
 		 1113 aa  47  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  24.62 
 
 		 437 aa  47  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  28 
 
 		 423 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.61 
 
 		 446 aa  47  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  23.1 
 
 		 1040 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0763  hypothetical protein  26.11 
 
 		 421 aa  47  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0376623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  25.79 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  25.57 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  25.97 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  23.02 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>