26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1779 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1779  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  942    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0201649  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1354  WD40 domain-containing protein  34.85 
 
 		 489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00427264  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  27.93 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.48 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  24.06 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  26.02 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.71 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  24.31 
 
 		 629 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  28.17 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 		 646 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  23.66 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  26.09 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  26.18 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  26.97 
 
 		 432 aa  44.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  23.69 
 
 		 1059 aa  44.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  35 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1812  hypothetical protein  24.89 
 
 		 575 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  27.01 
 
 		 1078 aa  44.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  36.25 
 
 		 438 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.44 
 
 		 673 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  35 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  24.66 
 
 		 434 aa  43.5  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  24.66 
 
 		 434 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  22.49 
 
 		 292 aa  43.1  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  32.5 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  23.75 
 
 		 1005 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>