116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3140 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3140  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1079  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  59.43 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  51.3 
 
 		 387 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.83 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3979  Carboxymuconolactone decarboxylase  49.58 
 
 		 252 aa  218  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22073  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001032  hypothetical protein  44.07 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.81 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.94 
 
 		 428 aa  194  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  45.54 
 
 		 403 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3258  carboxymuconolactone decarboxylase  46.05 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3786  carboxymuconolactone decarboxylase  45.54 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.310289 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5749  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.45 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0875  carboxymuconolactone decarboxylase  44.37 
 
 		 168 aa  123  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00171869  hitchhiker  0.0000000007488 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  29.49 
 
 		 261 aa  88.6  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  30.84 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.64 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  28.17 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.96 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  31.28 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  29.65 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  30.09 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.88 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  48.65 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  47.3 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  25.12 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  26.89 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  26.89 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  28.91 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  26.07 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.23 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.59 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.02 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  28.04 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  46.15 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  28.28 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.46 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.37 
 
 		 107 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.41 
 
 		 131 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.18 
 
 		 123 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.18 
 
 		 118 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.96 
 
 		 138 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 		 110 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  35.06 
 
 		 380 aa  52.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  39.47 
 
 		 133 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 		 128 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.24 
 
 		 152 aa  52  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.36 
 
 		 128 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 138 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 		 132 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  39.73 
 
 		 129 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.54 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4219  carboxymuconolactone decarboxylase  23.81 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.07 
 
 		 107 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  37.33 
 
 		 128 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  37.33 
 
 		 128 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  37.33 
 
 		 128 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5463  carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 		 110 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245296  normal  0.0559461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.33 
 
 		 128 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  36.99 
 
 		 130 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 106 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1515  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 		 110 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  45.76 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.971956  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 		 108 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  22.6 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2416  carboxymuconolactone decarboxylase  23.61 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.362249  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3396  carboxymuconolactone decarboxylase  27.39 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.346548  normal  0.629357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.29 
 
 		 105 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.22 
 
 		 127 aa  45.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 148 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  28.87 
 
 		 150 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.36 
 
 		 132 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.36 
 
 		 132 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 130 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.36 
 
 		 132 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.36 
 
 		 132 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.36 
 
 		 132 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.36 
 
 		 132 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.36 
 
 		 132 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 130 aa  45.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  29.79 
 
 		 108 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.24 
 
 		 107 aa  45.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  30.67 
 
 		 128 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.88 
 
 		 136 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.49 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0631  hypothetical protein  26.55 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.92 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  30.38 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.218972  normal  0.148336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.54 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  32.61 
 
 		 106 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 105 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1438  carboxymuconolactone decarboxylase  24.26 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6125  carboxymuconolactone decarboxylase  29.11 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  29.67 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  33.9 
 
 		 128 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  24.64 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.97 
 
 		 140 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>