296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1910 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
106 aa  219  9e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1625  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  70.59 
 
 
104 aa  163  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1085  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  67.62 
 
 
105 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0564788  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.57 
 
 
108 aa  155  2e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  66.02 
 
 
255 aa  149  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0425  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  62.5 
 
 
105 aa  147  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01020  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  54.13 
 
 
108 aa  124  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.141102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  56.44 
 
 
107 aa  119  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  53.85 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.49 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  54.9 
 
 
298 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.12 
 
 
140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.12 
 
 
140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.49 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  47.12 
 
 
140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  46.23 
 
 
108 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  55.91 
 
 
268 aa  107  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.08 
 
 
107 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  52.08 
 
 
105 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  46.67 
 
 
108 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  52.48 
 
 
276 aa  104  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.74 
 
 
107 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  50.54 
 
 
238 aa  102  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2039  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.83 
 
 
107 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1975  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.83 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05823e-17 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  50.54 
 
 
396 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  46.6 
 
 
259 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1757  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.74 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1800  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.44 
 
 
103 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1940  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.44 
 
 
103 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.94 
 
 
99 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5463  carboxymuconolactone decarboxylase  47.25 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245296  normal  0.0559461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1752  carboxymuconolactone decarboxylase  47.19 
 
 
102 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00315461  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  44.66 
 
 
283 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  41.75 
 
 
256 aa  94.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  44.66 
 
 
283 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2806  carboxymuconolactone decarboxylase  45.54 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  46.32 
 
 
265 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  46.39 
 
 
265 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  49.45 
 
 
398 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.27 
 
 
105 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  47.31 
 
 
239 aa  90.5  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  41.49 
 
 
262 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  45.16 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  43.01 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1515  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.96 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
393 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.14 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.14 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.14 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.11 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.68 
 
 
244 aa  74.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.63 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  42.22 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  41.57 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.03 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.89 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  41.03 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.03 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.03 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.03 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.03 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.96 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.74 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  39.58 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.62 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  41.24 
 
 
391 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 
402 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  40.43 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.26 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.89 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  41.03 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.95 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  38.54 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.79 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.36 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.36 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.36 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>