More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_02340 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
138 aa  278  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  60.98 
 
 
132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  58.87 
 
 
128 aa  157  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  60.33 
 
 
128 aa  156  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  58.06 
 
 
128 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  58.06 
 
 
133 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  58.06 
 
 
128 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  58.06 
 
 
128 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  61.16 
 
 
129 aa  153  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  57.26 
 
 
128 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  57.38 
 
 
125 aa  150  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  62.71 
 
 
152 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  53.54 
 
 
134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  59.35 
 
 
295 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  53.72 
 
 
125 aa  144  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  55.74 
 
 
132 aa  140  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  53.97 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  64 
 
 
109 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  60.98 
 
 
132 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.79 
 
 
132 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.79 
 
 
132 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.79 
 
 
132 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.79 
 
 
132 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.64 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.07 
 
 
131 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  49.18 
 
 
130 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  59.41 
 
 
123 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.39 
 
 
138 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  58.68 
 
 
145 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  60.82 
 
 
110 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  57.85 
 
 
144 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  57.02 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  58.76 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.8 
 
 
299 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  54.37 
 
 
275 aa  123  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  57.02 
 
 
144 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  57.02 
 
 
144 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  57.02 
 
 
144 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  56.67 
 
 
144 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  43.07 
 
 
150 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.88 
 
 
260 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  49.14 
 
 
261 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.72 
 
 
136 aa  106  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.57 
 
 
127 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  34.17 
 
 
122 aa  97.4  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  46.32 
 
 
128 aa  87.4  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  31.71 
 
 
380 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  41.41 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  38.14 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1368  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.52 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  37.9 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.32 
 
 
123 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.31 
 
 
250 aa  77.4  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  44.57 
 
 
125 aa  77  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.88 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.88 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2542  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0234299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1289  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  38.21 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.89 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0538  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  40.4 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2361  hypothetical protein  47.96 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1291  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0268  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.578525  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1029  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.54 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.57 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  43.96 
 
 
276 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  43.48 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  43.68 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  35.64 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  43.48 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  33.61 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.58 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.98 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.82 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  35.88 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  35.88 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2291  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.210071  normal  0.0104298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.24 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.18 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.58 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.58 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  34.51 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.58 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  38.61 
 
 
259 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.96 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  36.27 
 
 
238 aa  71.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.33 
 
 
248 aa  71.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.22 
 
 
249 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  42.05 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  44.83 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2237  carboxymuconolactone decarboxylase  43.62 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
268 aa  70.5  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>