285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1515 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



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Plasmid clonability

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1515  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
110 aa  219  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2806  carboxymuconolactone decarboxylase  60.58 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  52.83 
 
 
238 aa  99.8  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2039  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.43 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1800  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.43 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1940  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.43 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1975  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.43 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05823e-17 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.75 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1757  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.28 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.57 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.57 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  50.57 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  54.43 
 
 
396 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.94 
 
 
398 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5463  carboxymuconolactone decarboxylase  46.43 
 
 
110 aa  90.5  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245296  normal  0.0559461 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.45 
 
 
107 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.89 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.5 
 
 
105 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1752  carboxymuconolactone decarboxylase  44.58 
 
 
102 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00315461  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  54.43 
 
 
298 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  48.86 
 
 
239 aa  87  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  48.42 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.75 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  45 
 
 
276 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  46.32 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  50.59 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  48.81 
 
 
256 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0425  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.14 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  44.79 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.57 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  49.43 
 
 
268 aa  84  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  48.1 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.98 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  47.19 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  50 
 
 
262 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  48.78 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  48.78 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  48.75 
 
 
265 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  44.58 
 
 
264 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  49.37 
 
 
265 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.3 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  44.94 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  44.57 
 
 
123 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  44.57 
 
 
123 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1085  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  43.18 
 
 
105 aa  76.6  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0564788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.77 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.78 
 
 
255 aa  74.7  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0521  carboxymuconolactone decarboxylase  45.16 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00445095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  42.27 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  41.24 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  38.04 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1625  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  40.24 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.78 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  41.94 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.78 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0631  hypothetical protein  44.3 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01020  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  39.76 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.141102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.3 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.43 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  39.36 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.22 
 
 
127 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  40.45 
 
 
152 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  40.43 
 
 
393 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.22 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  41.46 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  39.33 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  38.2 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.63 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6820  carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.63 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.74 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.74 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2542  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0234299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1368  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.74 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1289  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.74 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.63 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.9 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1029  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.41 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA1291  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.41 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0268  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.41 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.578525  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0538  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.31 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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