289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2806 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2806  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
112 aa  226  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1515  Carboxymuconolactone decarboxylase  61.54 
 
 
110 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688858  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  51.92 
 
 
238 aa  99.8  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  47.52 
 
 
108 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  52.63 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.33 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
268 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  46.53 
 
 
276 aa  95.9  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.16 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  45.54 
 
 
106 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  48.35 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.35 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.35 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1975  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.05 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05823e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1757  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.05 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2039  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.05 
 
 
107 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202589  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.89 
 
 
107 aa  91.3  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1800  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.83 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1940  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.83 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.52 
 
 
398 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5463  carboxymuconolactone decarboxylase  45.98 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245296  normal  0.0559461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.59 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.24 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  50.62 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  45.45 
 
 
259 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1752  carboxymuconolactone decarboxylase  45.78 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00315461  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  49.43 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  39.78 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  47.78 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  43.48 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0425  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.96 
 
 
105 aa  82  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  41.76 
 
 
256 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  43.68 
 
 
298 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
264 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1085  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  41.76 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0564788  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  40.43 
 
 
396 aa  80.1  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  37.89 
 
 
265 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.49 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  39.56 
 
 
283 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  39.56 
 
 
283 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  41.41 
 
 
393 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1625  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  38 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  41.07 
 
 
262 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  38.3 
 
 
265 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  45.68 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0631  hypothetical protein  42.05 
 
 
242 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.3 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.05 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.78 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  45.24 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.46 
 
 
244 aa  73.6  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.62 
 
 
393 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.66 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  42.68 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  45.24 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.17 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.58 
 
 
393 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.58 
 
 
393 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.46 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.58 
 
 
393 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.58 
 
 
393 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.58 
 
 
393 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.17 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  38.3 
 
 
391 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.76 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.35 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.78 
 
 
255 aa  70.5  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  43.06 
 
 
397 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.74 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.43 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  41.98 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.51 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.51 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.51 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  31.73 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  40.86 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  30.69 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  36.9 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.51 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  39.51 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  39.51 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3492  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.16 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196165  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  34 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  31.63 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.95 
 
 
400 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  43.59 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.87 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  30.61 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  39.78 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.76 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.76 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
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NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.76 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  31.18 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
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