291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf083 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  100 
 
 
108 aa  222  1e-57  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  68.57 
 
 
106 aa  155  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1085  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  70.19 
 
 
105 aa  153  7e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0564788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1625  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  67.65 
 
 
104 aa  144  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0425  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  63.46 
 
 
105 aa  141  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  57.69 
 
 
255 aa  125  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.47 
 
 
107 aa  120  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  52 
 
 
107 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  53.19 
 
 
268 aa  113  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.19 
 
 
138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  47.96 
 
 
276 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.19 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  45.19 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.19 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  46.6 
 
 
105 aa  107  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  45.28 
 
 
298 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  41.51 
 
 
256 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  43.4 
 
 
108 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  45.71 
 
 
108 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  50.55 
 
 
259 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.52 
 
 
107 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  46.15 
 
 
106 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01020  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  47.22 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.141102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  47.83 
 
 
238 aa  99.4  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  47.12 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.94 
 
 
99 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.91 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  50.55 
 
 
396 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1752  carboxymuconolactone decarboxylase  49.41 
 
 
102 aa  97.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00315461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.55 
 
 
398 aa  96.7  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2039  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.38 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1800  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.44 
 
 
103 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1940  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.44 
 
 
103 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1975  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.19 
 
 
107 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05823e-17 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  46.74 
 
 
265 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1757  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5463  carboxymuconolactone decarboxylase  46.15 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245296  normal  0.0559461 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  44.09 
 
 
264 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.45 
 
 
105 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  43.62 
 
 
262 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  41.94 
 
 
265 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  43.48 
 
 
283 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  43.48 
 
 
283 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  41.94 
 
 
239 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2806  carboxymuconolactone decarboxylase  41 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1515  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
110 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  39.56 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
123 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 
244 aa  77.4  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
123 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  38.71 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  40.38 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.04 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.41 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.56 
 
 
393 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.56 
 
 
393 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.56 
 
 
393 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.56 
 
 
393 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.56 
 
 
393 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.56 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.2 
 
 
402 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.74 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.97 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  35.11 
 
 
393 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  33 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  33 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  37.5 
 
 
392 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 
135 aa  67  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  35.79 
 
 
391 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  36.96 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
133 aa  66.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.52 
 
 
128 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6127  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.93 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  31.52 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.52 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.52 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.52 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2049  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.44 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0437123  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.52 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.52 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.93 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.96 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  34.15 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.96 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.29 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
396 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  33.68 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  39.18 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.24 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>