291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3046 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 106 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  78.3 
 
 		 139 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  60.58 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  60.58 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  60.58 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  62.5 
 
 		 276 aa  140  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  64.58 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  68.04 
 
 		 107 aa  136  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  66.67 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  60.78 
 
 		 298 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  61.22 
 
 		 268 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  54.72 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.4 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  57.55 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  56.38 
 
 		 238 aa  115  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1625  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  50 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  54.44 
 
 		 256 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.08 
 
 		 255 aa  104  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  55.06 
 
 		 398 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  55.43 
 
 		 259 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  49.52 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.15 
 
 		 108 aa  102  3e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1085  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  48.39 
 
 		 105 aa  102  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0564788  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  47.83 
 
 		 264 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  46.39 
 
 		 265 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  46 
 
 		 265 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  51.14 
 
 		 396 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0425  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.05 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.24 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.43 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2039  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.05 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1975  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.96 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05823e-17 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  49.45 
 
 		 239 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1757  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.96 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  44.68 
 
 		 283 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  44.68 
 
 		 283 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  43.01 
 
 		 262 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1800  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.83 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1940  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.83 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1752  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00315461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2806  carboxymuconolactone decarboxylase  43.48 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_01020  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  37.63 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.141102 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.38 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1515  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.32 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5463  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245296  normal  0.0559461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  35.87 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.96 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  41.49 
 
 		 275 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  35.87 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  38.3 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  36.96 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.62 
 
 		 244 aa  73.6  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  36.26 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.48 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4519  carboxymuconolactone decarboxylase  36.96 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  35.87 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.87 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  37.08 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  37.08 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.56 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  35.87 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  38.82 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.7 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.7 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.7 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.7 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.7 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  36.9 
 
 		 396 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  39.33 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.95 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.46 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.79 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.04 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0594936 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  35.79 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.22 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  35.87 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.16 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.04 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
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