235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5463 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5463  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
110 aa  229  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245296  normal  0.0559461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1752  carboxymuconolactone decarboxylase  87.25 
 
 
102 aa  192  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00315461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  67.92 
 
 
107 aa  158  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2039  4-carboxymuconolactone decarboxylase  67.92 
 
 
107 aa  157  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1757  4-carboxymuconolactone decarboxylase  67.92 
 
 
107 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1975  4-carboxymuconolactone decarboxylase  68.63 
 
 
107 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05823e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1800  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  70.1 
 
 
103 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1940  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  70.1 
 
 
103 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  51.14 
 
 
105 aa  111  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0425  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.11 
 
 
105 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.81 
 
 
244 aa  98.6  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  44.09 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  47.25 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1085  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  48.31 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0564788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.62 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  45.88 
 
 
238 aa  94.4  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  46.59 
 
 
108 aa  94.4  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.79 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.41 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.15 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  41.94 
 
 
276 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.36 
 
 
255 aa  90.9  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  37.23 
 
 
256 aa  90.1  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.76 
 
 
140 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2806  carboxymuconolactone decarboxylase  45.98 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
259 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.76 
 
 
140 aa  89.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  37.76 
 
 
140 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.66 
 
 
99 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1625  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  43.96 
 
 
104 aa  89  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1515  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.34 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688858  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.56 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.2 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  39.36 
 
 
396 aa  84.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  40.96 
 
 
283 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  40.96 
 
 
283 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.48 
 
 
398 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  43.33 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  44.05 
 
 
268 aa  80.9  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  37.93 
 
 
262 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  40 
 
 
298 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
106 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  43.59 
 
 
239 aa  76.6  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  38.1 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 
265 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01020  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  32.29 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.141102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  33.71 
 
 
264 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.74 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  31.13 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.12 
 
 
393 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.22 
 
 
400 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.12 
 
 
393 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.12 
 
 
393 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.12 
 
 
393 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.12 
 
 
393 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.12 
 
 
393 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.88 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0631  hypothetical protein  30.34 
 
 
242 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  31.63 
 
 
275 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.44 
 
 
402 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1069  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.87 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00016362  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.68 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2291  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.52 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.210071  normal  0.0104298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.72 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.44 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  29.27 
 
 
123 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  34.72 
 
 
393 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.441447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  29.27 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  29.89 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.67 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  29.27 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  34.29 
 
 
393 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  29.9 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  30.59 
 
 
122 aa  55.1  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.87 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.95 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  29.89 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  29.9 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.46 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.67 
 
 
154 aa  53.9  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  31.33 
 
 
373 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.46 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3492  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.35 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196165  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  32.98 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  34.72 
 
 
397 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0333  carboxymuconolactone decarboxylase  31.65 
 
 
269 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0322  carboxymuconolactone decarboxylase  31.65 
 
 
269 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  36.36 
 
 
393 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>