More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4793 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
123 aa  250  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
123 aa  250  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  95.9 
 
 
123 aa  236  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.97 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 
138 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.32 
 
 
134 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.32 
 
 
134 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.5 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  38.46 
 
 
373 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
129 aa  86.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  36.44 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  47.67 
 
 
268 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  37.8 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.8 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  38.02 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.87 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 
126 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  36.51 
 
 
128 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  44.19 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.98 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  35.9 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6820  carboxymuconolactone decarboxylase  39.67 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  46.51 
 
 
259 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  36.51 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.4 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.34 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  39.45 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.3 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.39 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.07 
 
 
123 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  39.29 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.45 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  35.43 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  37.61 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.38 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  36.52 
 
 
392 aa  78.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  44.87 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.96 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.34 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.96 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  37.07 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  37.93 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.46 
 
 
108 aa  77  0.00000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  36.21 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  36.22 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.43 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.09 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  35.65 
 
 
396 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  43.02 
 
 
239 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.04 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  34.68 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.21 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.09 
 
 
130 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  32.48 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.9 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2049  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0437123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6125  carboxymuconolactone decarboxylase  35.9 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957093  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.46 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1515  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.74 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688858  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  42.5 
 
 
396 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.87 
 
 
398 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4519  carboxymuconolactone decarboxylase  31.67 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591188  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0745  carboxymuconolactone decarboxylase  37.19 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.186139  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  40.45 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  34.95 
 
 
256 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  33.05 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.17 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.2 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  37.1 
 
 
390 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  34.65 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  32.2 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  38.26 
 
 
393 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.65 
 
 
400 aa  70.5  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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