282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5713 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
107 aa  224  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  61.39 
 
 
138 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  59.6 
 
 
276 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  59.62 
 
 
298 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  55.88 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  58.82 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  55.88 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  55.88 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  57.84 
 
 
105 aa  130  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  55.34 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.48 
 
 
107 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  53.4 
 
 
106 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  52.94 
 
 
238 aa  120  7e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  55.43 
 
 
268 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  55 
 
 
107 aa  117  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  50.49 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  48.04 
 
 
259 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.57 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.11 
 
 
398 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1085  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  48.08 
 
 
105 aa  108  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0564788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.08 
 
 
99 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  48.08 
 
 
106 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  51.69 
 
 
256 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  48.31 
 
 
396 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.52 
 
 
108 aa  102  2e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  45.74 
 
 
262 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0425  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.31 
 
 
105 aa  99.4  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  48.35 
 
 
265 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  45.74 
 
 
283 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  45.74 
 
 
283 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  44.21 
 
 
265 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1625  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  42.57 
 
 
104 aa  96.7  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  46.59 
 
 
264 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  44 
 
 
255 aa  92  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
239 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1752  carboxymuconolactone decarboxylase  43.37 
 
 
102 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00315461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1800  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.24 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1940  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.24 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2039  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.91 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1975  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.68 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05823e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1757  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2806  carboxymuconolactone decarboxylase  49.43 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5463  carboxymuconolactone decarboxylase  38.2 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245296  normal  0.0559461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  40.66 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.38 
 
 
244 aa  83.6  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1515  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.78 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  41.3 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  41.3 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  37.86 
 
 
275 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  38.78 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.78 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.76 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  39.76 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.73 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.73 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.73 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.73 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.36 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.73 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.73 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.73 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  35.96 
 
 
380 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.35 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.5 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  37.65 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.74 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.74 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0521  carboxymuconolactone decarboxylase  38.37 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00445095  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.78 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.2 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.78 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 
138 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.04 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0631  hypothetical protein  32.98 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01020  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  29.29 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.141102 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.12 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  41.25 
 
 
392 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.27 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2049  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.27 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0437123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  35.11 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  32.58 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  45.59 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  41.33 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  42.11 
 
 
373 aa  63.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.75 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.67 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.8 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.75 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.75 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.75 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.75 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.75 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  43.08 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>