More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4934 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
150 aa  303  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  64.75 
 
 
136 aa  166  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  56.2 
 
 
128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  56.3 
 
 
128 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  55.37 
 
 
128 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  55.37 
 
 
128 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  55.37 
 
 
128 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  55.37 
 
 
128 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
125 aa  141  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.21 
 
 
132 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  52.85 
 
 
133 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  49.18 
 
 
134 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.81 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  48.33 
 
 
125 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.44 
 
 
132 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.44 
 
 
132 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.44 
 
 
132 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.44 
 
 
132 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  49.17 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.44 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.44 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.44 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  60.4 
 
 
123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 
152 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  47.5 
 
 
148 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.33 
 
 
152 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.83 
 
 
138 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.07 
 
 
138 aa  121  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  58.76 
 
 
118 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  49.58 
 
 
122 aa  121  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  49.6 
 
 
130 aa  120  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  48.87 
 
 
275 aa  120  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  53.33 
 
 
144 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  52.5 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  48.41 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  51.26 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  50.46 
 
 
109 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  42.98 
 
 
295 aa  114  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.01 
 
 
299 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  54.64 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
131 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.61 
 
 
260 aa  97.4  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  42.98 
 
 
261 aa  91.3  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  36.89 
 
 
380 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
238 aa  87.8  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 
129 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.6 
 
 
250 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  46.39 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  42.71 
 
 
259 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.19 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  41.88 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.96 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.87 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  44.21 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  47.87 
 
 
268 aa  80.9  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.35 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.29 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.75 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  35.59 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 
398 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
276 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.81 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.06 
 
 
128 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  35.07 
 
 
133 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.6 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  45 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.24 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  34.68 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.45 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.25 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  34.65 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  35.07 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  33.87 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 
265 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  41.18 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  30.95 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>