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for query gene Smed_0843 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
259 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  56.1 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  58.59 
 
 
283 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  58.59 
 
 
283 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  57.14 
 
 
239 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  52.47 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  55.56 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  50 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.19 
 
 
398 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  45.76 
 
 
396 aa  205  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0631  hypothetical protein  39.25 
 
 
242 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  39.91 
 
 
264 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  60.64 
 
 
108 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  56 
 
 
108 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  50.89 
 
 
238 aa  123  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  30.04 
 
 
295 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  57.61 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  54.26 
 
 
276 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.04 
 
 
107 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.4 
 
 
138 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  32.05 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  60.44 
 
 
107 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.63 
 
 
107 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  33.91 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  58.82 
 
 
105 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
140 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50 
 
 
140 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50 
 
 
140 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  57.61 
 
 
139 aa  105  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  51.49 
 
 
298 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  55.43 
 
 
106 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.55 
 
 
108 aa  103  4e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.76 
 
 
299 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  56.1 
 
 
99 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  52 
 
 
105 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  46.6 
 
 
106 aa  99  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1752  carboxymuconolactone decarboxylase  43.96 
 
 
102 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00315461  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 
261 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1625  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  38.83 
 
 
104 aa  92  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1085  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  40.2 
 
 
105 aa  92  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0564788  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0425  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.16 
 
 
105 aa  90.5  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2039  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.62 
 
 
107 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202589  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5463  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
110 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245296  normal  0.0559461 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1975  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.62 
 
 
107 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05823e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1757  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.43 
 
 
107 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.45 
 
 
132 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.32 
 
 
255 aa  87  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1800  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.91 
 
 
103 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1940  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.91 
 
 
103 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.28 
 
 
281 aa  85.9  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  45.65 
 
 
123 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2806  carboxymuconolactone decarboxylase  45.45 
 
 
112 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.86 
 
 
107 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3396  carboxymuconolactone decarboxylase  30.86 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.346548  normal  0.629357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  42.71 
 
 
150 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.13 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  38.18 
 
 
128 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  38.18 
 
 
128 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.18 
 
 
128 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0343  carboxymuconolactone decarboxylase  30.67 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0333  carboxymuconolactone decarboxylase  30.67 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0322  carboxymuconolactone decarboxylase  30.67 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  46.51 
 
 
123 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  46.51 
 
 
123 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.27 
 
 
128 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.51 
 
 
131 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.61 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  38.05 
 
 
128 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.51 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  36.7 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.15 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1515  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.3 
 
 
110 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1906  carboxymuconolactone decarboxylase  31.93 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528731  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  37.23 
 
 
125 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1438  carboxymuconolactone decarboxylase  28.5 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4219  carboxymuconolactone decarboxylase  28.05 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  35.45 
 
 
129 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.86 
 
 
125 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3140  hypothetical protein  28.17 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  41.11 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.18 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1079  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.57 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  34.74 
 
 
134 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2291  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.69 
 
 
122 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.210071  normal  0.0104298 
 
 
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NC_013457  VEA_001032  hypothetical protein  28.78 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.17 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.78 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  35.78 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.78 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
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NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  28.71 
 
 
387 aa  72  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  39.08 
 
 
128 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  34.69 
 
 
109 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
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NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.24 
 
 
129 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.67 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
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NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.61 
 
 
138 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
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NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  34.88 
 
 
124 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
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NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.64 
 
 
134 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
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NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 
129 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
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NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.21 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
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