More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1856 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
275 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  49.42 
 
 
299 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  46.09 
 
 
295 aa  208  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  41.7 
 
 
261 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.89 
 
 
260 aa  175  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  56.56 
 
 
133 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  55.38 
 
 
152 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  56.67 
 
 
129 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  58.33 
 
 
132 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  56.67 
 
 
132 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  56.67 
 
 
132 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  55.12 
 
 
148 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  56.67 
 
 
132 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  56.67 
 
 
132 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  56.67 
 
 
132 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  56.67 
 
 
132 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  56.67 
 
 
132 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.85 
 
 
132 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  52.42 
 
 
128 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  52.89 
 
 
125 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  51.61 
 
 
128 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  51.61 
 
 
128 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.61 
 
 
128 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.8 
 
 
131 aa  139  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.03 
 
 
128 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  51.22 
 
 
128 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
134 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.15 
 
 
138 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.56 
 
 
152 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  62.89 
 
 
123 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  62.89 
 
 
118 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  60.83 
 
 
144 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.5 
 
 
125 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  58.73 
 
 
144 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  56.06 
 
 
132 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  57.48 
 
 
145 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  57.58 
 
 
144 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  57.94 
 
 
144 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  57.94 
 
 
144 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  48.87 
 
 
150 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  55.81 
 
 
144 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  54.37 
 
 
138 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  49.22 
 
 
136 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  57 
 
 
109 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  59.79 
 
 
110 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  32.19 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  47.93 
 
 
130 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.85 
 
 
398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  31.44 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.38 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  29.74 
 
 
396 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  47.83 
 
 
122 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.05 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.33 
 
 
250 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  33.62 
 
 
239 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  29.24 
 
 
265 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.63 
 
 
127 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  27.97 
 
 
363 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  28.33 
 
 
283 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  28.33 
 
 
283 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  28 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  29.31 
 
 
262 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0343  carboxymuconolactone decarboxylase  30.19 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0322  carboxymuconolactone decarboxylase  30.19 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0333  carboxymuconolactone decarboxylase  30.19 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1906  carboxymuconolactone decarboxylase  31.44 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528731  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3396  carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.346548  normal  0.629357 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  44.9 
 
 
140 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.9 
 
 
140 aa  89.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.9 
 
 
140 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.7 
 
 
428 aa  87  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  29.74 
 
 
387 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 
403 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4219  carboxymuconolactone decarboxylase  30.05 
 
 
252 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.69 
 
 
244 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.32 
 
 
249 aa  85.9  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.75 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  30.45 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  36.81 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.81 
 
 
138 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.15 
 
 
107 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.34 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1438  carboxymuconolactone decarboxylase  31.75 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  35.25 
 
 
380 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3786  carboxymuconolactone decarboxylase  32.8 
 
 
262 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.310289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1079  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  44.57 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  45.16 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3258  carboxymuconolactone decarboxylase  32.8 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.02 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2361  hypothetical protein  50.47 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.86 
 
 
107 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3979  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.35 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22073  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  40.62 
 
 
108 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3140  hypothetical protein  31.28 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 
134 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.54 
 
 
107 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001032  hypothetical protein  29.33 
 
 
238 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.39 
 
 
140 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.22317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>