More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2188 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
129 aa  260  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  83.05 
 
 
152 aa  199  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  69.11 
 
 
128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  69.11 
 
 
128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  69.11 
 
 
128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.29 
 
 
128 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  67.48 
 
 
128 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  69.92 
 
 
133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  67.48 
 
 
125 aa  180  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  67.48 
 
 
128 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  64.8 
 
 
134 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  65.6 
 
 
125 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  65.85 
 
 
132 aa  176  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  66.67 
 
 
132 aa  176  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  66.67 
 
 
132 aa  176  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  66.67 
 
 
132 aa  176  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  66.67 
 
 
132 aa  176  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  66.67 
 
 
132 aa  175  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  66.67 
 
 
132 aa  175  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  66.67 
 
 
132 aa  175  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  79.61 
 
 
109 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  67.2 
 
 
132 aa  173  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  73.39 
 
 
132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  66.94 
 
 
152 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  68.64 
 
 
148 aa  168  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  82.47 
 
 
110 aa  168  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  64.71 
 
 
138 aa  166  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  69.05 
 
 
144 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  73.55 
 
 
145 aa  164  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  71.7 
 
 
123 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  68.25 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  69.05 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  65.6 
 
 
299 aa  162  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  69.05 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  69.05 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  68.25 
 
 
144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  62.6 
 
 
130 aa  157  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  58.59 
 
 
131 aa  157  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  61.16 
 
 
138 aa  153  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  71.13 
 
 
118 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  53.6 
 
 
295 aa  142  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  56.67 
 
 
275 aa  131  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  60.95 
 
 
261 aa  130  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  49.17 
 
 
150 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  56.25 
 
 
260 aa  130  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.77 
 
 
136 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  42.37 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  44.54 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  37.07 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
363 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  36.44 
 
 
380 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
129 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.02 
 
 
123 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0952  Carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 
127 aa  86.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.83 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  38.84 
 
 
392 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.52 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.83 
 
 
250 aa  85.5  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  35.2 
 
 
373 aa  84.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  35.61 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  38.98 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  44.21 
 
 
268 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 
129 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  41.32 
 
 
125 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  38.66 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.21 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  35.61 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  36.89 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  38.02 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  36.07 
 
 
396 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.25 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 
238 aa  80.5  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  38.84 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  39.2 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.39 
 
 
127 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1368  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0268  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.578525  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1291  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2542  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0234299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.26 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1289  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1029  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.2 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0538  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.02 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.45 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.4 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  38.21 
 
 
386 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.45 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.45 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
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NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  35.25 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
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NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.12 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.75 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  41.3 
 
 
276 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
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