298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1289 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1289  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2542  4-carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0234299  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0538  4-carboxymuconolactone decarboxylase  98.48 
 
 		 185 aa  266  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1368  4-carboxymuconolactone decarboxylase  99.24 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1029  4-carboxymuconolactone decarboxylase  98.48 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0268  4-carboxymuconolactone decarboxylase  98.48 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.578525  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1291  4-carboxymuconolactone decarboxylase  98.48 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  93.18 
 
 		 132 aa  253  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  87.88 
 
 		 132 aa  236  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  88.64 
 
 		 132 aa  235  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  85.61 
 
 		 154 aa  234  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5410  carboxymuconolactone decarboxylase  87.12 
 
 		 132 aa  234  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0441836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  86.36 
 
 		 155 aa  233  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  86.36 
 
 		 155 aa  233  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3859  carboxymuconolactone decarboxylase  85.61 
 
 		 132 aa  230  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604596 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  77.52 
 
 		 131 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  77.52 
 
 		 131 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  66.4 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.84 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  56.91 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  59.02 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  62.07 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  59.84 
 
 		 126 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  54.62 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  56.2 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  58.59 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  59.2 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  56.41 
 
 		 127 aa  140  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4526  carboxymuconolactone decarboxylase  54.4 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  56.67 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.07 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0750  putative carboxymuconolactone decarboxylase  52 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.061099  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0745  carboxymuconolactone decarboxylase  52 
 
 		 153 aa  130  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.186139  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.24 
 
 		 134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.24 
 
 		 134 aa  130  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0900  carboxymuconolactone decarboxylase  51.91 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.67 
 
 		 123 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1326  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.85 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.75 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  51.24 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  50.85 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  50.85 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  50.85 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  50.85 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  52.14 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.88 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5508  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.8 
 
 		 125 aa  121  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  48.78 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.53 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  45.83 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  43.9 
 
 		 126 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1473  Carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2527  carboxymuconolactone decarboxylase  50.43 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  47.37 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  41.03 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  44.63 
 
 		 373 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01252  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.25 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  44.88 
 
 		 133 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  44.88 
 
 		 133 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.26 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0521  carboxymuconolactone decarboxylase  48.33 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00445095  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0976  putative gamma carboxymuconolactone decarboxylase  43.09 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.602862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2960  carboxymuconolactone decarboxylase  38.52 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00839552  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  42.61 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.22 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.09 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.09 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.97 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.09 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.09 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.09 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.83 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  44.83 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  46.28 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.06 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.09 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02910  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.63 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5797  carboxymuconolactone decarboxylase  40.65 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10545  normal  0.0382532 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1965  carboxymuconolactone decarboxylase  40.18 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0644561  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  43.8 
 
 		 392 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6127  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.76 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.22 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.22 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.73 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0381  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.77 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.07667  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3252  carboxymuconolactone decarboxylase  43.93 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0448  carboxymuconolactone decarboxylase  40.77 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1216  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.77 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0658576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.86 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.98 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  44.74 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4519  carboxymuconolactone decarboxylase  42.74 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.86 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>