More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3222 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
248 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.97 
 
 
281 aa  264  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.88 
 
 
250 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.95 
 
 
257 aa  216  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.26 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20540  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  35.66 
 
 
255 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125919  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  47.5 
 
 
127 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1559  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  31.32 
 
 
181 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000751375  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  30.16 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  32.11 
 
 
295 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.97 
 
 
260 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  31.05 
 
 
275 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
299 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 
398 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.93 
 
 
136 aa  88.6  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  26.36 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  24.02 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  31.5 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  34.96 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3258  carboxymuconolactone decarboxylase  28.09 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40 
 
 
128 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3786  carboxymuconolactone decarboxylase  28.09 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.310289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  26.51 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001032  hypothetical protein  31.84 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
233 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 
128 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 
128 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.07 
 
 
152 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 
128 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.76 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  39.77 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  37.9 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3979  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.5 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22073  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.04 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  35.65 
 
 
393 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  34.75 
 
 
134 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.9 
 
 
125 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  23.81 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5749  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.72 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  23.71 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.18 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  37.63 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  26.55 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.33 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  35.96 
 
 
380 aa  72  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  26.4 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  35.14 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  28.33 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.33 
 
 
138 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  43.18 
 
 
110 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 
132 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  32.71 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.57 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.9 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.45 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  32.48 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.57 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.64 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0717  carboxymuconolactone decarboxylase  35.05 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.226817  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 
127 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.79 
 
 
131 aa  67.8  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
123 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  32.76 
 
 
124 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.55 
 
 
129 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3140  hypothetical protein  27.88 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  24.55 
 
 
283 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.61 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1069  Carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
118 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00016362  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  24.55 
 
 
283 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  22.67 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  33.61 
 
 
148 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22780  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  36.59 
 
 
123 aa  67  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0718259  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.74 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.93 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  37.96 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  33.93 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  35.48 
 
 
373 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  22.82 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  37.96 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 
129 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0425  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.23 
 
 
105 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1079  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.44 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  30.16 
 
 
133 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1856  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.9 
 
 
138 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.177717  normal  0.121417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.64 
 
 
132 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.03 
 
 
128 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  29.66 
 
 
129 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  29.66 
 
 
129 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  34.82 
 
 
145 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>