226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20540 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_20540  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  100 
 
 
255 aa  501  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125919  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.59 
 
 
250 aa  263  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.49 
 
 
257 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.38 
 
 
249 aa  185  5e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.66 
 
 
248 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.84 
 
 
281 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1559  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  38.59 
 
 
181 aa  143  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000751375  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  46.72 
 
 
127 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3346  4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.77 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  27.31 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.16 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3979  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.95 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.66 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  38.83 
 
 
133 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3258  carboxymuconolactone decarboxylase  30.73 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 
129 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.14 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  43.42 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  46.05 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  24.09 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.29 
 
 
132 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.29 
 
 
132 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.86 
 
 
136 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.29 
 
 
132 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  26.64 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.29 
 
 
132 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.59 
 
 
138 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.29 
 
 
132 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  27.31 
 
 
256 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.29 
 
 
132 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.29 
 
 
132 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  35.53 
 
 
122 aa  67  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  36.89 
 
 
150 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.86 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3786  carboxymuconolactone decarboxylase  30.17 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.310289 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  29.25 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  36.07 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  33.04 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  33.62 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  25.45 
 
 
396 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 
138 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.34 
 
 
152 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.72 
 
 
244 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 
130 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1079  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.11 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5749  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.48 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.88 
 
 
125 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001032  hypothetical protein  26.09 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  34.17 
 
 
134 aa  62  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  37.29 
 
 
144 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.06 
 
 
428 aa  61.6  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.05 
 
 
131 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.47 
 
 
118 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  25.52 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.93 
 
 
127 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.23 
 
 
398 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22780  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  31.25 
 
 
123 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0718259  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.47 
 
 
123 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 
130 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  30.4 
 
 
129 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
380 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  41.43 
 
 
128 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  36.44 
 
 
144 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  37.29 
 
 
144 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  37.29 
 
 
144 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  28.16 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  37.29 
 
 
144 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
125 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.16 
 
 
132 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
144 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.31 
 
 
135 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.93 
 
 
134 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  36.89 
 
 
132 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3459  carboxymuconolactone decarboxylase  31.9 
 
 
136 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  hitchhiker  0.00164993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40 
 
 
128 aa  58.9  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  30.09 
 
 
152 aa  58.9  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
128 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
128 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.86 
 
 
134 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.86 
 
 
134 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
128 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
128 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  28.71 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2049  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.83 
 
 
133 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0437123  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  28.71 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.86 
 
 
134 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.4 
 
 
138 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  24.11 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.4 
 
 
138 aa  56.6  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
127 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
125 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
123 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  29.91 
 
 
128 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  28.29 
 
 
265 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  30.63 
 
 
128 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.1 
 
 
134 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  36.47 
 
 
145 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.63 
 
 
128 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>