278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2511 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
281 aa  577  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.97 
 
 
248 aa  263  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.42 
 
 
250 aa  262  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.57 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.18 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20540  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  34.84 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125919  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1559  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  38.92 
 
 
181 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000751375  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  47.2 
 
 
127 aa  126  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  32.38 
 
 
275 aa  108  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.19 
 
 
299 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  27.27 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.7 
 
 
398 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  27.1 
 
 
396 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  29.28 
 
 
259 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.04 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  25.3 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  26.99 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 
122 aa  75.1  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4713  carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  33.05 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3786  carboxymuconolactone decarboxylase  25.82 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.310289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.05 
 
 
128 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  34.21 
 
 
128 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.82 
 
 
132 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.71 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001032  hypothetical protein  30.36 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  34.21 
 
 
128 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  34.21 
 
 
128 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.3 
 
 
136 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.21 
 
 
128 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 
125 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  31.86 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  31.3 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.48 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.48 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3258  carboxymuconolactone decarboxylase  28.48 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.48 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.48 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.48 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.48 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.48 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  22.86 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3910  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.984224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 
134 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  37.37 
 
 
133 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  24.15 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  24.3 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3979  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.85 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22073  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.82 
 
 
428 aa  65.9  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.23 
 
 
126 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.98 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.71 
 
 
107 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  38.2 
 
 
124 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.2 
 
 
127 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
110 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  38.82 
 
 
109 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  39.08 
 
 
128 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0717  carboxymuconolactone decarboxylase  38.27 
 
 
147 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.226817  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  38.2 
 
 
127 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.76 
 
 
152 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5749  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.2 
 
 
221 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  27.53 
 
 
403 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  39.77 
 
 
123 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  37.93 
 
 
128 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  31.3 
 
 
129 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1458  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34 
 
 
132 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  32.48 
 
 
144 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4879  carboxymuconolactone decarboxylase  38.64 
 
 
123 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0552117 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.56 
 
 
138 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
144 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4793  carboxymuconolactone decarboxylase  38.64 
 
 
123 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.575162  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
144 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
144 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  26.42 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3566  carboxymuconolactone decarboxylase  34 
 
 
132 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199431  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5046  carboxymuconolactone decarboxylase  33.01 
 
 
154 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.336576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.96 
 
 
138 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  34.12 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  34.65 
 
 
155 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  31.62 
 
 
144 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.3 
 
 
152 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  34.65 
 
 
155 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22780  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  31.33 
 
 
123 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0718259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  32.48 
 
 
144 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  26.52 
 
 
298 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 
145 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
125 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.29 
 
 
123 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 
131 aa  60.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.01 
 
 
132 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
127 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1368  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
132 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  34.78 
 
 
396 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2446  carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
132 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  32.99 
 
 
392 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  31.87 
 
 
132 aa  59.3  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>